RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv5-12-4A0A0A6YWG4 117 aa16.77■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fcrl6A1YIY0 268 aa16.77■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cst7O89098 144 aa16.77■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10192Q3V0S1 108 aa16.77■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hes7Q8BKT2 225 aa16.77■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Oraov1Q8CH62 137 aa16.77■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zg16Q8K0C5 167 aa16.77■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc17a9Q8VCL5 447 aa16.77■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr266Q8VFC3 316 aa16.77■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znrf1Q91V17 227 aa16.77■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ifitm2Q99J93 144 aa16.77■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gng10Q9CXP8 68 aa16.77■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lurap1Q9D6I9 239 aa16.77■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccl1P10146 92 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rnase9P60154 184 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AmelxP63277 210 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Txn2P97493 166 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem52bQ0VBF2 186 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Duxbl2Q7TNE6 350 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zmat4Q8BZ94 229 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr577Q8VH11 312 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prss37Q9DAA4 237 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ly96Q9JHF9 160 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav16A0A075B653 116 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm21775J3KMK6 180 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Twist1P26687 206 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 StumQ0VBF8 141 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fbln7Q501P1 440 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav6d-4Q5R1I0 115 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr147Q60886 317 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dtx1Q61010 627 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prickle3Q80VL3 624 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 B430305J03RikQ8BQQ8 176 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nit1Q8VDK1 323 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr476Q8VGI4 310 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vstm5Q9D806 199 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm6993A0A1W2P738 69 aa16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm21900J3QP38 180 aa16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rab33bO35963 229 aa16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ren2P00796 401 aa16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01789 122 aa16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Col8a2P25318 699 aa16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gata4Q08369 441 aa16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm4792Q569Q2 183 aa16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Actl6bQ99MR0 426 aa16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ChtopQ9CY57 249 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fkbp11Q9D1M7 201 aa16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dopey1Q8BL99 2399 aa16.75■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm9964E9Q9S5 144 aa16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm21060J3KMU4 56 aa16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cldn34c3J3QJW5 233 aa16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cldn34c2J3QNM1 233 aa16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 GchfrP99025 84 aa16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tctn2Q2MV57 700 aa16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Isg15Q64339 161 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rph3alQ768S4 302 aa16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cldn34c1Q8K193 234 aa16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RetnlgQ8K426 117 aa16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmed6Q9CQG0 239 aa16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AmtnQ9D3J8 213 aa16.74■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm20379A0A087WR34 119 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1189A2AV11 306 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm15217A2CG07 155 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01723 117 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01788 123 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P04943 107 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv3-6P18531 116 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Reg1P43137 165 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc36a4Q8CH36 500 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q9D7E4 109 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnajc13D4AFX7 2248 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav7n-4A0A075B620 113 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccl11P48298 97 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1419Q7TQS2 343 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rhbdd1Q8BHC7 315 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rhbdd2Q8VEK2 361 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cysrt1Q9D1E4 142 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm12728V9GX31 77 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hivep2Q3UHF7 2430 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zcchc24B2RVL6 241 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm9602J3QPD5 205 aa16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P18525 117 aa16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ang4Q3TMQ6 144 aa16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q8C3M9 231 aa16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AplnrQ9WV08 377 aa16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spint5J3KMK8 105 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pla2g2cP48076 150 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 A930003A15RikQ3U552 87 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RprmlQ3URD2 117 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smim9Q3V0X1 137 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1457Q8VFK3 317 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr177E9Q7W1 309 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PigyP0C1P0 71 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pla2g2aP31482 146 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ifna11Q61716 190 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dlx1Q64317 255 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr303Q8VFP0 319 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4930583I09RikQ9D2E3 102 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccl28Q9JIL2 130 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trank1Q8BV79 2999 aa16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.2 ms