RNA–Protein interactions for RNA: YMR270C

RRN9, Transcript of Protein involved in promoting high level transcription of rDNA, yeast

Gene RRN9, Length 1,098 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN9	YMR270C	SAD1	P43589	448 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	NIT2	P47016	307 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	YGR153W	P48238	217 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	CUL3	P53202	744 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	YNL146W	P53906	100 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	IES4	Q08561	116 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	HAP2	P06774	265 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	YER152C	P10356	443 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	DAL3	P32459	195 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	AFR1	P33304	620 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	NNK1	P36003	928 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	UBP13	P38187	747 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	MMS4	P38257	691 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	EXO84	P38261	753 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	RIM4	P38741	713 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	CAF16	P43569	289 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	CTF18	P49956	741 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	AIM14	P53109	570 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	RSC3	Q06639	885 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	DCS2	Q12123	353 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRN9	YMR270C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	PCK1	P10963	549 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	HMG2	P12684	1045 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	PTH2	P34222	208 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	HMT1	P38074	348 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	RFC5	P38251	354 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	VID24	P38263	362 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	YAR028W	P39548	234 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	THI6	P41835	540 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	YPL150W	Q12152	901 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	MYO1	P08964	1928 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	HMG1	P12683	1054 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	APE1	P14904	514 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	BET2	P20133	325 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	NPP1	P25353	742 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	PPZ1	P26570	692 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	PRO1	P32264	428 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	SSH4	P32343	579 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	YSC83	P32792	385 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	REC104	P33323	182 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	TRM2	P33753	639 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	HEL1	P36113	551 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	PIH1	P38768	344 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	GIP4	P39732	760 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	YEL076C	P39971	216 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	VTC2	P43585	828 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
RRN9	YMR270C	UBA2	P52488	636 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	VTC3	Q02725	835 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	ATG33	Q06485	197 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	MLC2	Q06580	163 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	IRC10	Q08118	586 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	RMP1	Q12530	201 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	HOG1	P32485	435 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	MNN4	P36044	1178 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	KTR4	P38131	464 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	YHL041W	P38730	149 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	YER186C	P40101	306 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RRN9	YMR270C	HIS6	P40545	261 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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