RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W PRE2P30656 287 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W DSS4P32601 143 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data5.18□□□□□ -1.58not detected
YKR047WYKR047W REV7P38927 245 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W IDS2P46958 469 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W MPS3P47069 682 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W ARR3Q06598 404 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W CDA2Q06703 312 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W AIM6Q07716 390 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W SDH5Q08230 162 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W IRC13Q08630 104 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W ERP4Q12450 207 aa5.18□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W PET122P10355 254 aa5.17□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W MRP7P12687 371 aa5.17□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data5.17□□□□□ -1.58not detected
YKR047WYKR047W STE11P23561 717 aa5.17□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W CBF2P32504 956 aa5.17□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W RIC1P40395 1056 aa5.17□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W LYS14P40971 790 aa5.17□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W ZAP1P47043 880 aa5.17□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W MNN10P50108 393 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W IMH1Q06704 911 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W SUL2Q12325 893 aa5.17□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W SEM1O94742 89 aa5.16□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W SWC3P31376 625 aa5.16□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W GCD7P32502 381 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W PHO11P35842 467 aa5.16□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W PHO12P38693 467 aa5.16□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W COS12P53053 380 aa5.16□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W COG1P53079 417 aa5.16□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W PRP43P53131 767 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W RBG2P53295 368 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W SPC19Q03954 165 aa5.16□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W IZH3Q07959 543 aa5.16□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W TRM13Q12383 476 aa5.16□□□□□ -1.58
YKR047WYKR047W YLR302CO13544 120 aa5.15□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W YLR358CO13565 187 aa5.15□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W MAC1P35192 417 aa5.15□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W NUP120P35729 1037 aa5.15□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W UBS1P38290 277 aa5.15□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W ARB1P40024 610 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W KHA1P40309 873 aa5.15□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W YJL163CP46996 555 aa5.15□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W BUL1P48524 976 aa5.15□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W BSC5P53755 489 aa5.15□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W FRE5Q08908 694 aa5.15□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W SKM1Q12469 655 aa5.15□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W YKL033W-AQ86ZR7 236 aa5.15□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W PRP6P19735 899 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W VPS34P22543 875 aa5.14□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W FUB1P25659 250 aa5.14□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W CMK1P27466 446 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W ELF1P36053 145 aa5.14□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W MRPL7P36519 292 aa5.14□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W CTP1P38152 299 aa5.14□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W FMP52P40008 231 aa5.14□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W YJR061WP40355 935 aa5.14□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W IST3P40565 148 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W SKP2P42843 763 aa5.14□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W TAM41P53230 385 aa5.14□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W MLH3Q12083 715 aa5.14□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W NBP2Q12163 236 aa5.14□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W ATP2P00830 511 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W SIR3P06701 978 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W TY2A-FP0CX61 438 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W TY2A-GR2P0CX62 438 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W MET8P15807 274 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W ERG4P25340 473 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W TY2A-CP25383 438 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W NFU1P32860 256 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W MDG1P53885 366 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W TY2A-DR2Q03483 438 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W VAM6Q07468 1049 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W TY2A-BQ12260 438 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W TY2A-OR2Q12293 438 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W TY2A-DR1Q12392 438 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W TY2A-OR1Q12439 438 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W TY2A-DR3Q99303 438 aa5.13□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W ABF1P14164 731 aa5.12□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W CAP1P28495 268 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W EFT1P32324 842 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W VTC2P43585 828 aa5.12□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W FHN1P53279 174 aa5.12□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W YAP1802P53309 568 aa5.12□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W TIM10P87108 93 aa5.12□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W REG1Q00816 1014 aa5.12□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W TDA9Q04545 1251 aa5.12□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W CRF1Q04930 467 aa5.12□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W YDL086WQ07505 273 aa5.12□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W USV1Q12132 391 aa5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.5 ms