RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597777.1

FARP1-222, Transcript of FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 1, human

Gene FARP1, Length 3,841 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FARP1-222	ENST00000597777	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FARP1-222	ENST00000597777	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FARP1-222	ENST00000597777	F13A1	P00488	732 aa		11.4	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ZNF165	P49910	485 aa		11.4	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	SCARF1	Q14162	830 aa		11.4	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		11.4	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ZAP70	P43403	619 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ANAPC15	P60006	121 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777		A0A1B0GVL5	298 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777		H0YIN7	160 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	SERPINC1	P01008	464 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	MAP7D2	Q96T17	732 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	RASGRF1	Q13972	1273 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	RUFY3	Q7L099	469 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	C8orf76	Q96K31	380 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ERCC3	P19447	782 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	CACNA1S	Q13698	1873 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	PTGS1	P23219	599 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	BCAM	P50895	628 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	MTFR1L	Q9H019	292 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	GGA1	Q9UJY5	639 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ZNF213	O14771	459 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	GPSM2	P81274	684 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	CNKSR1	Q969H4	720 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	LIG1	P18858	919 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	SLC27A2	O14975	620 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	UBE3C	Q15386	1083 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	PHKB	Q93100	1093 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	NAPB	Q9H115	298 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	TPM4	P67936	248 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	HSPA4	P34932	840 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	GYG1	P46976	350 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	TERF1	P54274	439 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	INCENP	Q9NQS7	918 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	CCDC69	A6NI79	296 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ZNF445	P59923	1031 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	CFAP100	Q494V2	611 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	APPBP2	Q92624	585 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	KCNB2	Q92953	911 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ADD2	P35612	726 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	MAP3K12	Q12852	859 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	MAP4K1	Q92918	833 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	PLIN2	Q99541	437 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777		F8W031	263 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	POLD1	P28340	1107 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	LRMP	Q12912	555 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	STAM	Q92783	540 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	UFL1	O94874	794 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	DNA2	P51530	1060 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	SLX4	Q8IY92	1834 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	UBE2H	P62256	183 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	PPARD	Q03181	441 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		11.35	□□□□□ -0.59

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