RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L12C9JPN9 530 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L21D6R901 530 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 PKP1Q13835 747 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 RHBDL3P58872 404 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 AOC3Q16853 763 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 DACT2Q5SW24 774 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 HHIPL2Q6UWX4 724 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 INCENPQ9NQS7 918 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSWIM5Q9P217 1185 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 SCN9AQ15858 1988 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 ORC4O43929 436 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 GJB2P29033 226 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 MCM4P33991 863 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 LIFRP42702 1097 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 USP5P45974 858 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 SCRN1Q12765 414 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 NBR1Q14596 966 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 GBP4Q96PP9 640 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L3A6NCW0 530 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L4A6NCW7 530 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 KDM4AO75164 1064 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 STK3Q13188 491 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 SGMS1Q86VZ5 419 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXW7Q969H0 707 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 ROBO3Q96MS0 1386 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 PSME4Q14997 1843 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 PPIP5K2O43314 1243 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 C12orf60Q5U649 245 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 ESR2Q92731 530 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 PTGER2P43116 358 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 LY9Q9HBG7 655 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 MCM9Q9NXL9 1143 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 FOCADQ5VW36 1801 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 SYT1P21579 422 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 TEX11Q8IYF3 940 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 MXD3Q9BW11 206 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L8P0C7I0 530 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 PDCP20941 246 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM67Q5HYA8 995 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 TMTC2Q8N394 836 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 NID2Q14112 1375 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 YDJCA8MPS7 323 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 SMIM22K7EJ46 135 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 STX6O43752 255 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 CTDNEP1O95476 244 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP2D6P10635 497 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 SART3Q15020 963 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 AMOTL1Q8IY63 956 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 TEKT1Q969V4 418 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 BAG4O95429 457 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 PDE4BQ07343 736 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 ZDHHC15Q96MV8 337 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 TOMM22Q9NS69 142 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 FLT1P17948 1338 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA8BA8MQT2 603 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 CRKP46108 304 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 RCAN1P53805 252 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 F8W031 263 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 PTMSP20962 102 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 CCT2P78371 535 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 SEC23AQ15436 765 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 APOA5Q6Q788 366 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 MTMR6Q9Y217 621 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 ERICH2A1L162 156 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-207ENST00000589146 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
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