RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa36.74■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D10CQ8IV04 446 aa36.74■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa36.74■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L12C9JPN9 530 aa36.73■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L21D6R901 530 aa36.73■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 CPA1P15085 419 aa36.73■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 NT5C2P49902 561 aa36.73■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 AK2P54819 239 aa36.73■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 MFSD6Q6ZSS7 791 aa36.73■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 OGFOD1Q8N543 542 aa36.73■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT23Q9C075 422 aa36.73■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 LMNB1P20700 586 aa36.72■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS12P25398 132 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF6P56537 245 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXL16Q8N461 479 aa36.72■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 MCM9Q9NXL9 1143 aa36.72■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 MINDY4BA8MYZ0 360 aa36.71■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 MCM5P33992 734 aa36.71■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 USP40Q9NVE5 1235 aa36.7■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa36.7■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC4A3P48751 1232 aa36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP36.69■■■■□ 3.462e-8■■■□□ 16.5
CAPNS1-206ENST00000588815 CTDSPL2Q05D32 466 aa36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 MYH8P13535 1937 aa36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 FLT1P17948 1338 aa36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 ROBO3Q96MS0 1386 aa36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 SOCS7O14512 581 aa36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 NPM3O75607 178 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 FGRP09769 529 aa36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 PRELPP51888 382 aa36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L8P0C7I0 530 aa36.68■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 C12orf60Q5U649 245 aa36.68■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 AGXT2Q9BYV1 514 aa36.68■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP100Q494V2 611 aa36.67■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa36.67■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 MTMR14Q8NCE2 650 aa36.67■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 MTA3Q9BTC8 594 aa36.67■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 TMX3Q96JJ7 454 aa36.66■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 NEDD4P46934 1319 aa36.65■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 FGD1P98174 961 aa36.64■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZUG5 572 aa36.64■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 DPF2Q92785 391 aa36.64■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 IDI2Q9BXS1 227 aa36.64■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
CAPNS1-206ENST00000588815 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 PDE4BQ07343 736 aa36.63■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 ORC4O43929 436 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 ESR2Q92731 530 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 B4E1Z4 1266 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 PRC1O43663 620 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP36.62■■■■□ 3.454e-7■■■□□ 18.5
CAPNS1-206ENST00000588815 CUL4AQ13619 759 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 DLGAP5Q15398 846 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM87BQ96K49 555 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 TCEANC2Q96MN5 208 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF287Q9HBT7 754 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa36.61■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 SPDYE2BA6NHP3 402 aa36.61■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 SPDYE6P0CI01 402 aa36.61■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 TAOK2Q9UL54 1235 aa36.61■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP36.61■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC6Q86TZ1 520 aa36.6■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 TOMM22Q9NS69 142 aa36.59■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 TACC3Q9Y6A5 838 aa36.59■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 ANTXR2P58335 489 aa36.58■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 TMOD2Q9NZR1 351 aa36.58■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 KDM4AO75164 1064 aa36.57■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP2D6P10635 497 aa36.57■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSWIM5Q9P217 1185 aa36.57■■■■□ 3.45
CAPNS1-206ENST00000588815 EVCP57679 992 aa36.56■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 PICALMQ13492 652 aa36.56■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 SART3Q15020 963 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 BRF1Q92994 677 aa36.56■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 ENTPD3O75355 529 aa36.56■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 CYB5R4Q7L1T6 521 aa36.56■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 TPCN1Q9ULQ1 816 aa36.56■■■■□ 3.44
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa36.56■■■■□ 3.44
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