RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 DCAF15Q66K64 600 aa22.62■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.62■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 HAUS7Q99871 368 aa22.62■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 ELP3Q9H9T3 547 aa22.62■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.62■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.62■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 TSKSQ9UJT2 592 aa22.62■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 WNK4Q96J92 1243 aa22.61■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 WRNIP1Q96S55 665 aa22.61■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.61■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 OTOFQ9HC10 1997 aa22.6■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 SLURP2P0DP57 97 aa22.6■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 GJA5P36382 358 aa22.6■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.6■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.6■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 DOCK2Q92608 1830 aa22.59■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 PDE6AP16499 860 aa22.59■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.59■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.59■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 CSADQ9Y600 493 aa22.59■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.59■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 PLCG2P16885 1265 aa22.58■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 LBX1P52954 281 aa22.58■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.58■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 GCC1Q96CN9 775 aa22.58■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 OPTNQ96CV9 577 aa22.58■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 GPATCH3Q96I76 525 aa22.58■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 AK9Q5TCS8 1911 aa22.58■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 IGHDP01880 384 aa22.57■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 INPP5BP32019 993 aa22.57■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.57■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 RNF186Q9NXI6 227 aa22.57■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.57■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.57■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.57■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.56■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 TM4SF4P48230 202 aa22.56■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 CA12O43570 354 aa22.55■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 TRPA1O75762 1119 aa22.55■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 CHGBP05060 677 aa22.55■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 FLT1P17948 1338 aa22.55■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM196BA6NMK8 535 aa22.54■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.54■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP3K10Q02779 954 aa22.54■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 SREBF2Q12772 1141 aa22.54■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 OTUD5Q96G74 571 aa22.54■■□□□ 1.2
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GCSHP2-201ENST00000560971 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.53■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.53■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 ADD2P35612 726 aa22.53■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.53■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 MX1P20591 662 aa22.52■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.52■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 ERO1BQ86YB8 467 aa22.52■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 SMC5Q8IY18 1101 aa22.52■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.52■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.52■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.52■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 PALD1Q9ULE6 856 aa22.52■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.52■■□□□ 1.2
GCSHP2-201ENST00000560971 TBC1D12O60347 775 aa22.51■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 USP5P45974 858 aa22.51■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.51■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 CERS3Q8IU89 383 aa22.51■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.5■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 LCORLQ8N3X6 602 aa22.5■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.5■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 LNPKQ9C0E8 428 aa22.5■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 ARMT1Q9H993 441 aa22.5■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 IRF6O14896 467 aa22.49■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 ERC2O15083 957 aa22.49■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 INHBEP58166 350 aa22.49■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 UBE3CQ15386 1083 aa22.49■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 IFNL1Q8IU54 200 aa22.49■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.49■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 PTPN18Q99952 460 aa22.49■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.49■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 FOCADQ5VW36 1801 aa22.48■■□□□ 1.19
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