RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa29.67■■■□□ 2.34
ACER3-211ENST00000531461 SCYL3Q8IZE3 742 aa29.67■■■□□ 2.34
ACER3-211ENST00000531461 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
ACER3-211ENST00000531461 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa29.66■■■□□ 2.34
ACER3-211ENST00000531461 BCAR3O75815 825 aa29.66■■■□□ 2.34
ACER3-211ENST00000531461 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
ACER3-211ENST00000531461 BTDP43251 543 aa29.66■■■□□ 2.34
ACER3-211ENST00000531461 PTPRFP10586 1907 aa29.66■■■□□ 2.34
ACER3-211ENST00000531461 EN2P19622 333 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
ACER3-211ENST00000531461 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
ACER3-211ENST00000531461 MECOMQ03112 1051 aa29.65■■■□□ 2.34
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ACER3-211ENST00000531461 DOCK1Q14185 1865 aa29.65■■■□□ 2.34
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ACER3-211ENST00000531461 ZNF384Q8TF68 577 aa29.64■■■□□ 2.34
ACER3-211ENST00000531461 NEUROD6Q96NK8 337 aa29.64■■■□□ 2.34
ACER3-211ENST00000531461 PHIPQ8WWQ0 1821 aa29.64■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa29.63■■■□□ 2.33
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ACER3-211ENST00000531461 RHBDL3P58872 404 aa29.63■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 GPAT2Q6NUI2 795 aa29.63■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 SPATA5Q8NB90 893 aa29.63■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 PICK1Q9NRD5 415 aa29.63■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 CPA4Q9UI42 421 aa29.63■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 TNNQ9UQP3 1299 aa29.63■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 TBC1D12O60347 775 aa29.62■■■□□ 2.33
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ACER3-211ENST00000531461 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP29.62■■■□□ 2.33
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ACER3-211ENST00000531461 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 GCC1Q96CN9 775 aa29.62■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa29.62■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 ZHX2Q9Y6X8 837 aa29.62■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 LDHCP07864 332 aa29.61■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 CTGFP29279 349 aa29.61■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 GSTO1P78417 241 aa29.61■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
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ACER3-211ENST00000531461 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa29.61■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 MGAMO43451 1857 aa29.6■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 BCRP11274 1271 aa29.6■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 HOXD10P28358 340 aa29.6■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 PSMC4P43686 418 aa29.6■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 GORABQ5T7V8 394 aa29.6■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.6■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 TRIM47Q96LD4 638 aa29.6■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 PCDH10Q9P2E7 1040 aa29.6■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 PICALMQ13492 652 aa29.59■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.59■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 GPR108Q9NPR9 543 aa29.59■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa29.58■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa29.58■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 PI16Q6UXB8 463 aa29.58■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 SH3TC2Q8TF17 1288 aa29.58■■■□□ 2.33
ACER3-211ENST00000531461 MCAMP43121 646 aa29.57■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 POLA2Q14181 598 aa29.57■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 TMEM57Q8N5G2 664 aa29.57■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 OSBPP22059 807 aa29.56■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa29.56■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 CYP2C8P10632 490 aa29.55■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 SSH3Q8TE77 659 aa29.55■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 IGSF3O75054 1194 aa29.54■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 RAI14Q9P0K7 980 aa29.54■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 MAST2Q6P0Q8 1798 aa29.54■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 SLURP2P0DP57 97 aa29.53■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 ATP8B2P98198 1209 aa29.53■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 ATAD5Q96QE3 1844 aa29.52■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 MYPNQ86TC9 1320 aa29.52■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 GRK4P32298 578 aa29.52■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 FCGRTP55899 365 aa29.52■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 RAET1EQ8TD07 263 aa29.52■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 TBC1D2Q9BYX2 928 aa29.52■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 LRP2BPQ9P2M1 347 aa29.52■■■□□ 2.32
ACER3-211ENST00000531461 TNNI3KQ59H18 835 aa29.51■■■□□ 2.31
ACER3-211ENST00000531461 GADL1Q6ZQY3 521 aa29.51■■■□□ 2.31
ACER3-211ENST00000531461 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
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ACER3-211ENST00000531461 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa29.51■■■□□ 2.31
ACER3-211ENST00000531461 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa29.5■■■□□ 2.31
ACER3-211ENST00000531461 TRIM75PA6NK02 468 aa29.49■■■□□ 2.31
ACER3-211ENST00000531461 CCDC158Q5M9N0 1113 aa29.49■■■□□ 2.31
ACER3-211ENST00000531461 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
ACER3-211ENST00000531461 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
ACER3-211ENST00000531461 FOCADQ5VW36 1801 aa29.49■■■□□ 2.31
ACER3-211ENST00000531461 LOC285556D6RIA3 1793 aa29.49■■■□□ 2.31
ACER3-211ENST00000531461 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa29.48■■■□□ 2.31
ACER3-211ENST00000531461 MYCP01106 439 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
ACER3-211ENST00000531461 MTFR1Q15390 333 aa29.48■■■□□ 2.31
ACER3-211ENST00000531461 TEX11Q8IYF3 940 aa29.48■■■□□ 2.31
ACER3-211ENST00000531461 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
ACER3-211ENST00000531461 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
ACER3-211ENST00000531461 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
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