RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 ANAPC4Q9UJX5 808 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 DUOX1Q9NRD9 1551 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 IGSF3O75054 1194 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 KDM4AO75164 1064 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 PPARAQ07869 468 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 SDR42E1Q8WUS8 393 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA32Q96LK8 384 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 BRIP1Q9BX63 1249 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 INCENPQ9NQS7 918 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 KIF13BQ9NQT8 1826 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 LTBP1Q14766 1721 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 NID2Q14112 1375 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 XDHP47989 1333 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 CPLX1O14810 134 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 GIMAP6Q6P9H5 292 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 CFAP45Q9UL16 551 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4D-208ENST00000502484 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 MECOMQ03112 1051 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 ATL3Q6DD88 541 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 SENP2Q9HC62 589 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 CD2APQ9Y5K6 639 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 C10orf71Q711Q0 1435 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB43O43298 467 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 PDE6BP35913 854 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 TSPY26PQ9H489 355 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 PPFIA3O75145 1194 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 CDKL5O76039 1030 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 PRDX5P30044 214 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 FOSBP53539 338 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 C8orf76Q96K31 380 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 NAV1Q8NEY1 1877 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 CDC27P30260 824 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC173Q0VFZ6 552 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 NTRK3Q16288 839 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 SLC51AQ86UW1 340 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 MICU3Q86XE3 530 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R9BQ96SB3 815 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC69A6NI79 296 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 MINDY4BA8MYZ0 360 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 H0YIN7 160 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 FGRP09769 529 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 RCAN1P53805 252 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 TGFB2P61812 414 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 GUCY1B3Q02153 619 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF804AQ7Z570 1209 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 TMTC2Q8N394 836 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 WDR66Q8TBY9 1149 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 PGBD1Q96JS3 809 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 SYT17Q9BSW7 474 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 TOMM22Q9NS69 142 aa9.56□□□□□ -0.88
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PDE4D-208ENST00000502484 ERICH2A1L162 156 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.56□□□□□ -0.88
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PDE4D-208ENST00000502484 RXRAP19793 462 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 ATP2B4P23634 1241 aa9.56□□□□□ -0.88
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PDE4D-208ENST00000502484 GPSM2P81274 684 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 WTAPQ15007 396 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 NLGN2Q8NFZ4 835 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 ESR2Q92731 530 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 CRAMP1Q96RY5 1269 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 STK36Q9NRP7 1315 aa9.55□□□□□ -0.88
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