RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495879.1

PTPRG-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRG, Length 3,011 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-207ENST00000495879 TC2NQ8N9U0 490 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 TOMM22Q9NS69 142 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 KCNJ6P48051 423 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 USP54Q70EL1 1684 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 ARHGAP6O43182 974 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 ZMYM6O95789 1325 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 TRIM29Q14134 588 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 RGPD5Q99666 1765 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 CCP110O43303 1012 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 JMYQ8N9B5 988 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 MED15Q96RN5 788 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 TEX33O43247 280 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 GPTP24298 496 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 SNAP23O00161 211 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 ZBTB43O43298 467 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 NR5A1Q13285 461 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 METTL24Q5JXM2 366 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 PPP6R2O75170 966 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 MAP3K9P80192 1104 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 FBXL16Q8N461 479 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 MRFAP1Q9Y605 127 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRG-207ENST00000495879 AFMP43652 599 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 POSTNQ15063 836 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 MCM6Q14566 821 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 KIFC2Q96AC6 838 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 CPDO75976 1380 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 NTRK3Q16288 839 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 STAMQ92783 540 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 H3BQF6 201 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 CUTAO60888 179 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 ABL1P00519 1130 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 ARFGAP3Q9NP61 516 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 FAM205CA6NFA0 338 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 OXER1Q8TDS5 423 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 CIAO1O76071 339 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 LMAN1P49257 510 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 RAD9BQ6WBX8 426 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 LY9Q9HBG7 655 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 CDKL5O76039 1030 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 ADD2P35612 726 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 FUT8Q9BYC5 575 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 RAI14Q9P0K7 980 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 TUBB4AP04350 444 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 PHKA1P46020 1223 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRG-207ENST00000495879 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.3 ms