RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491937.5

RPS7-209, Transcript of ribosomal protein S7, human

TSL 2

Gene RPS7, Length 987 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS7-209	ENST00000491937	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	BTD	P43251	543 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	PICK1	Q9NRD5	415 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	TRIM27	P14373	513 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	PSMC4	P43686	418 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	CTGF	P29279	349 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	MECOM	Q03112	1051 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	PICALM	Q13492	652 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	TRIM47	Q96LD4	638 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	SRRD	Q9UH36	339 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	GNAI2	P04899	355 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	HOXD10	P28358	340 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	MAP3K10	Q02779	954 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	PTPRA	P18433	802 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	GORAB	Q5T7V8	394 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		32.51	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	OSBP	P22059	807 aa		32.51	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		32.51	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	CYP2C8	P10632	490 aa		32.5	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	SPATA5	Q8NB90	893 aa		32.5	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	BCR	P11274	1271 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	RAET1E	Q8TD07	263 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	TNN	Q9UQP3	1299 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	BCAR3	O75815	825 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	RHBDL3	P58872	404 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	GSTO1	P78417	241 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	32.48	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	PI16	Q6UXB8	463 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	ZNF384	Q8TF68	577 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	MYPN	Q86TC9	1320 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		32.47	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	LDHC	P07864	332 aa		32.47	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	SLURP2	P0DP57	97 aa		32.47	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	DOCK1	Q14185	1865 aa		32.47	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		32.47	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	GRK4	P32298	578 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	FCGRT	P55899	365 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	RAI14	Q9P0K7	980 aa		32.45	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		32.45	■■■□□ 2.79
RPS7-209	ENST00000491937	MTFR1	Q15390	333 aa		32.44	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	TRIM75P	A6NK02	468 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	TBC1D12	O60347	775 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	CEP290	O15078	2479 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	PTPRF	P10586	1907 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	PRKCZ	Q05513	592 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	32.42	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	MCAM	P43121	646 aa		32.41	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		32.41	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	FAM196B	A6NMK8	535 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	SHISA4	Q96DD7	197 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RPS7-209	ENST00000491937	MGAM	O43451	1857 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RPS7-209	ENST00000491937	TEX11	Q8IYF3	940 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RPS7-209	ENST00000491937	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RPS7-209	ENST00000491937	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
RPS7-209	ENST00000491937	CCL5	P13501	91 aa		32.37	■■■□□ 2.77
RPS7-209	ENST00000491937	UBXN2A	P68543	259 aa		32.37	■■■□□ 2.77
RPS7-209	ENST00000491937	GPR108	Q9NPR9	543 aa		32.37	■■■□□ 2.77
RPS7-209	ENST00000491937	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
RPS7-209	ENST00000491937	GABRQ	Q9UN88	632 aa		32.36	■■■□□ 2.77
RPS7-209	ENST00000491937	GJB1	P08034	283 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RPS7-209	ENST00000491937	POLA2	Q14181	598 aa		32.35	■■■□□ 2.77

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