RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480416.1

TNS1-215, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-215ENST00000480416 VWA5B2Q8N398 1253 aa4.5□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa4.5□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 BCL2L13Q9BXK5 485 aa4.5□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa4.5□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 SLC52A2Q9HAB3 445 aa4.5□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 KCNQ5Q9NR82 932 aa4.5□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 STAP2Q9UGK3 403 aa4.5□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 A0A087WZG4 1122 aa4.49□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa4.49□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 MEN1O00255 615 aa4.49□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 RNMTO43148 476 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 FBXO45P0C2W1 286 aa4.49□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 MAP3K10Q02779 954 aa4.49□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 HLFQ16534 295 aa4.49□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 SVOPQ8N4V2 548 aa4.49□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 DEFB123Q8N688 67 aa4.49□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 CD99L2Q8TCZ2 262 aa4.49□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 CDCA5Q96FF9 252 aa4.49□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 MTMR10Q9NXD2 777 aa4.49□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 ZNRF3Q9ULT6 936 aa4.49□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 FZD1Q9UP38 647 aa4.49□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 LAMB4A4D0S4 1761 aa4.49□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 H7C1D1 291 aa4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 KCNQ3O43525 872 aa4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 ADD1P35611 737 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 ERVK-9P63128 1117 aa4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 C1orf141Q5JVX7 400 aa4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 TPTE2Q6XPS3 522 aa4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 ARMC5Q96C12 935 aa4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 ZNF333Q96JL9 665 aa4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 TRERF1Q96PN7 1200 aa4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 TESK2Q96S53 571 aa4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 CARD11Q9BXL7 1154 aa4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 ENAMQ9NRM1 1142 aa4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 USP16Q9Y5T5 823 aa4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 KIF24Q5T7B8 1368 aa4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 SCN7AQ01118 1682 aa4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 PSMD14O00487 310 aa4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 SLURP2P0DP57 97 aa4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 MARSP56192 900 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 KCNMA1Q12791 1236 aa4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 NEUROD1Q13562 356 aa4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 PRKG1Q13976 671 aa4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 AMOTQ4VCS5 1084 aa4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 WDR44Q5JSH3 913 aa4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 SH3TC2Q8TF17 1288 aa4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 SHISA4Q96DD7 197 aa4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 ABCC12Q96J65 1359 aa4.47□□□□□ -1.69
TNS1-215ENST00000480416 MRC1P22897 1456 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 A0A1W2PRU2 124 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 STARD3NLO95772 234 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 PLA2G5P39877 138 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 CLN3Q13286 438 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 MTFR1Q15390 333 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 CRY2Q49AN0 593 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 SULT6B1Q6IMI4 303 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 TRIM22Q8IYM9 498 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 TMEM151AQ8N4L1 468 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 FAM122AQ96E09 287 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 FAM161BQ96MY7 647 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 CFHR5Q9BXR6 569 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 DBNDD1Q9H9R9 158 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 EFCC1Q9HA90 598 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 GGA3Q9NZ52 723 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 DYRK1BQ9Y463 629 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 CDH23Q9H251 3354 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 KIF20BQ96Q89 1820 aa4.46□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa4.45□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 GNRH1P01148 92 aa4.45□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 KRT76Q01546 638 aa4.45□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 KIAA2012Q0VF49 1180 aa4.45□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 TNIP1Q15025 636 aa4.45□□□□□ -1.7
TNS1-215ENST00000480416 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.2 ms