RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 SHPRHQ149N8 1683 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRK-211ENST00000429595 ABCC3O15438 1527 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRK-211ENST00000429595 MAP3K1Q13233 1512 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRK-211ENST00000429595 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRK-211ENST00000429595 EREGO14944 169 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRK-211ENST00000429595 CLEC10AQ8IUN9 316 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRK-211ENST00000429595 NXPE3Q969Y0 559 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRK-211ENST00000429595 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRK-211ENST00000429595 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRK-211ENST00000429595 CCNB3Q8WWL7 1395 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRK-211ENST00000429595 PCSK2P16519 638 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRK-211ENST00000429595 SSFA2P28290 1259 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRK-211ENST00000429595 BEND4Q6ZU67 534 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRK-211ENST00000429595 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRK-211ENST00000429595 OSMRQ99650 979 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRK-211ENST00000429595 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 LRP5O75197 1615 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 GP2P55259 537 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 NCOA2Q15596 1464 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 TIAM1Q13009 1591 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 SLIT1O75093 1534 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 TNFRSF21O75509 655 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 NPR3P17342 541 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 PMEPA1Q969W9 287 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 ERVK-7P63135 1459 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 MEGF11A6BM72 1044 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 FDX2Q6P4F2 183 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 DEFB132Q7Z7B7 95 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 DTX1Q86Y01 620 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 BSNDQ8WZ55 320 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 NWD1Q149M9 1564 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 DLGAP3O95886 979 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 TTC16Q8NEE8 873 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 HIF3AQ9Y2N7 669 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 FZD6O60353 706 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 PHACTR2O75167 634 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 TSPY4P0CV99 314 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 TSPY10P0CW01 314 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 GRIK1P39086 918 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 IRAK1P51617 712 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 IKBKEQ14164 716 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 SGO2Q562F6 1265 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 BRINP3Q76B58 766 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 ARL4DP49703 201 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRK-211ENST00000429595 EEA1Q15075 1411 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 WDR64B1ANS9 1081 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 GAS2O43903 313 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 TIAF1O95411 115 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 EDN3P14138 238 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 MFSD14AQ96MC6 490 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 USP26Q9BXU7 913 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 CARNS1A5YM72 827 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 METTL12A8MUP2 240 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 SHISA5Q8N114 240 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 AAMPQ13685 434 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRK-211ENST00000429595 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.7 ms