RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 USP17L22D6RA61 530 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 USP17L17D6RBQ6 530 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 USP17L19D6RCP7 530 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 USP17L20D6RJB6 530 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMPRSS2O15393 492 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 GRIN3BO60391 1043 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCDH1Q08174 1060 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 USP17L24Q0WX57 530 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM132EQ6IEE7 984 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTC16Q8NEE8 873 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 PEX10O60683 326 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLFN14P0C7P3 912 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCSK2P16519 638 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 NKPD1Q17RQ9 610 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 XKR5Q6UX68 686 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC16A11Q8NCK7 471 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 MYLIPQ8WY64 445 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 FANCD2OSQ96PS1 177 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 ALPK1Q96QP1 1244 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 BDH2Q9BUT1 245 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 MCOLN1Q9GZU1 580 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 FSHBP01225 129 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 IRF2BP1Q8IU81 584 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 FEZF2Q8TBJ5 459 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 SAP130Q9H0E3 1048 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RNU6-187P-201ENST00000384139 TNFRSF1AP19438 455 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 ID3Q02535 119 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF827Q17R98 1081 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM26DQ5JW98 314 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 HHIPL2Q6UWX4 724 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTC6Q86TZ1 520 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 TNFRSF10BO14763 440 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 MCM6Q14566 821 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTLL4Q14679 1199 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC6A17Q9H1V8 727 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 STIM2Q9P246 746 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 AP3B2Q13367 1082 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF423Q2M1K9 1284 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 FRMD5Q7Z6J6 570 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF605Q86T29 641 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP4.31□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 FOXQ1Q9C009 403 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATP13A1Q9HD20 1204 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 K7ESM1 405 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 RAD21O60216 631 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 ECEL1O95672 775 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHRDQ9H2X0 955 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLAMF8Q9P0V8 285 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A096LPE4 126 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A1W2PPZ6 126 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC22A31A6NKX4 558 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 POM121CA8CG34 1229 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 GDF5P43026 501 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM214BQ7L5A3 538 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM200AQ8TCP9 573 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADAM7Q9H2U9 754 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 VRTNQ9H8Y1 702 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 DISC1Q9NRI5 854 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 IRAK3Q9Y616 596 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 METTL12A8MUP2 240 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 EREGO14944 169 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 PHACTR2O75167 634 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 LIG1P18858 919 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 PI3P19957 117 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 C8orf34Q49A92 452 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 HSPA12BQ96MM6 686 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARXQ96QS3 562 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 MRIQ9BWK5 157 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRDM10Q9NQV6 1147 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM59LQ9UK28 342 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-187P-201ENST00000384139 MATN3O15232 486 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-187P-201ENST00000384139 B3GALT4O96024 378 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-187P-201ENST00000384139 HPXP02790 462 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-187P-201ENST00000384139 SSPNQ14714 243 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-187P-201ENST00000384139 CRB2Q5IJ48 1285 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-187P-201ENST00000384139 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RNU6-187P-201ENST00000384139 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms