RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa35.35■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 ANO2Q9NQ90 1003 aa35.35■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 MYH1P12882 1939 aa35.34■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa35.34■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 PGAP2Q9UHJ9 254 aa35.34■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 CLEC11AQ9Y240 323 aa35.34■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 PTH1RQ03431 593 aa35.33■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 CNTNAP1P78357 1384 aa35.33■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 NPM3O75607 178 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.25
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ECHS1-201ENST00000368547 IFNL3Q8IZI9 196 aa35.32■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 DDRGK1Q96HY6 314 aa35.32■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 DSCC1Q9BVC3 393 aa35.32■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 ENTPD3O75355 529 aa35.32■■■■□ 3.24
ECHS1-201ENST00000368547 ZFPM1Q8IX07 1006 aa35.32■■■■□ 3.24
ECHS1-201ENST00000368547 NACAP1Q9BZK3 213 aa35.32■■■■□ 3.24
ECHS1-201ENST00000368547 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
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ECHS1-201ENST00000368547 TNNI2P48788 182 aa35.31■■■■□ 3.24
ECHS1-201ENST00000368547 GIMAP6Q6P9H5 292 aa35.31■■■■□ 3.24
ECHS1-201ENST00000368547 FAM83AQ86UY5 434 aa35.31■■■■□ 3.24
ECHS1-201ENST00000368547 REC8O95072 547 aa35.3■■■■□ 3.24
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ECHS1-201ENST00000368547 NAPBQ9H115 298 aa35.29■■■■□ 3.24
ECHS1-201ENST00000368547 MCM9Q9NXL9 1143 aa35.29■■■■□ 3.24
ECHS1-201ENST00000368547 DEFB129Q9H1M3 183 aa35.28■■■■□ 3.24
ECHS1-201ENST00000368547 FGAP02671 866 aa35.28■■■■□ 3.24
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ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D32Q96NH3 1257 aa35.28■■■■□ 3.24
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM39BQ9GZU3 492 aa35.28■■■■□ 3.24
ECHS1-201ENST00000368547 PALD1Q9ULE6 856 aa35.28■■■■□ 3.24
ECHS1-201ENST00000368547 ALX1Q15699 326 aa35.27■■■■□ 3.24
ECHS1-201ENST00000368547 MAP4K1Q92918 833 aa35.27■■■■□ 3.24
ECHS1-201ENST00000368547 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa35.26■■■■□ 3.24
ECHS1-201ENST00000368547 KRT26Q7Z3Y9 468 aa35.26■■■■□ 3.24
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L12C9JPN9 530 aa35.25■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L21D6R901 530 aa35.25■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 CTR9Q6PD62 1173 aa35.25■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 LAMB1P07942 1786 aa35.25■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 KIF3CO14782 793 aa35.24■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa35.24■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 ZMYM6O95789 1325 aa35.24■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 ADM5C9JUS6 153 aa35.24■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
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ECHS1-201ENST00000368547 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 ATRNL1Q5VV63 1379 aa35.23■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 CYP2D6P10635 497 aa35.22■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 USP48Q86UV5 1035 aa35.22■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 CDAN1Q8IWY9 1227 aa35.22■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa35.22■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 SBK1Q52WX2 424 aa35.21■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa35.21■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 CDC37L1Q7L3B6 337 aa35.21■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 AMOTL1Q8IY63 956 aa35.21■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 TEPSINQ96N21 525 aa35.21■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 C22orf23Q9BZE7 217 aa35.21■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 CTNNA3Q9UI47 895 aa35.21■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 MINDY4BA8MYZ0 360 aa35.21■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 EVX2Q03828 476 aa35.21■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 DLK2Q6UY11 383 aa35.21■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 LAMA4Q16363 1823 aa35.2■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 PLCD1P51178 756 aa35.2■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 C12orf60Q5U649 245 aa35.2■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 CSRNP1Q96S65 589 aa35.2■■■■□ 3.23
ECHS1-201ENST00000368547 SIPA1L1O43166 1804 aa35.2■■■■□ 3.23
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ECHS1-201ENST00000368547 USP26Q9BXU7 913 aa35.19■■■■□ 3.22
ECHS1-201ENST00000368547 SMIM22K7EJ46 135 aa35.18■■■■□ 3.22
ECHS1-201ENST00000368547 HLA-DOAP06340 250 aa35.18■■■■□ 3.22
ECHS1-201ENST00000368547 CHADLQ6NUI6 762 aa35.18■■■■□ 3.22
ECHS1-201ENST00000368547 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
ECHS1-201ENST00000368547 HAND2P61296 217 aa35.17■■■■□ 3.22
ECHS1-201ENST00000368547 PPARAQ07869 468 aa35.17■■■■□ 3.22
ECHS1-201ENST00000368547 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
ECHS1-201ENST00000368547 PI4KBQ9UBF8 816 aa35.17■■■■□ 3.22
ECHS1-201ENST00000368547 NECTIN1Q15223 517 aa35.16■■■■□ 3.22
ECHS1-201ENST00000368547 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
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