RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 SLFN14P0C7P3 912 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 LILRA6Q6PI73 481 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 NPHS2Q9NP85 383 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 CTNND2Q9UQB3 1225 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 FYB2Q5VWT5 728 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 FAM214BQ7L5A3 538 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 SNX11Q9Y5W9 270 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 NCANO14594 1321 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 ISL2Q96A47 359 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 KRT1P04264 644 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 KRT82Q9NSB4 513 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 ZP2Q05996 745 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 IKZF1Q13422 519 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 SPACA3Q8IXA5 215 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 PPP1R16BQ96T49 567 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 PRRG2O14669 202 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 ORC1Q13415 861 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 PDZD3Q86UT5 571 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 ASB11Q8WXH4 323 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 ABL1P00519 1130 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 ECM1Q16610 540 aa9□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 NKPD1Q17RQ9 610 aa9□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 ANKLE2Q86XL3 938 aa9□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 GLI1P08151 1106 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 C1QTNF9P0C862 333 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 B8ZZF3 427 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 AFMP43652 599 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 RNF214Q8ND24 703 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 STK35Q8TDR2 534 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 MTMR7Q9Y216 660 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 NEFLP07196 543 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 KCNB2Q92953 911 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 ERVK-24P63145 666 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 GRM2Q14416 872 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 KIRREL1Q96J84 757 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 FAM129BQ96TA1 746 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 NTF4P34130 210 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 CARNS1A5YM72 827 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 CYFIP1Q7L576 1253 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 PRDM10Q9NQV6 1147 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 ICMTO60725 284 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 CLCN7P51798 805 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM67Q5HYA8 995 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 AMIGO3Q86WK7 504 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 EOMESO95936 686 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 IGHA2P01877 340 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 SULF2Q8IWU5 870 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 NFIBO00712 420 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 DIRC2Q96SL1 478 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 KCNK12Q9HB15 430 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms