RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 TBC1D10CQ8IV04 446 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 NEK1Q96PY6 1258 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 FLT1P17948 1338 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 PICALMQ13492 652 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 DLGAP5Q15398 846 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 MICALL2Q8IY33 904 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 DPF2Q92785 391 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 BECN1Q14457 450 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 RUFY3Q7L099 469 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 MYH1P12882 1939 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 HSCBQ8IWL3 235 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 SPDYE6P0CI01 402 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 CYP2D6P10635 497 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 TRDNQ13061 729 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 SBK1Q52WX2 424 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 H7C1D1 291 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 CACNB3P54284 484 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 AKNAD1Q5T1N1 836 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 SNX21Q969T3 373 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 ANAPC4Q9UJX5 808 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 RPS6KB1P23443 525 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 MMP14P50281 582 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 NCOA7Q8NI08 942 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 SMIM22K7EJ46 135 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 NFIAQ12857 509 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 STAG1Q8WVM7 1258 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 TOMM22Q9NS69 142 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 NEDD4P46934 1319 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 EVX2Q03828 476 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 INCENPQ9NQS7 918 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXA4-201ENST00000360046 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 C12orf60Q5U649 245 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 IL27Q8NEV9 243 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 CNNM2Q9H8M5 875 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 TTC14Q96N46 770 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 CLRN2A0PK11 232 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 MYO1BO43795 1136 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 EPS15P42566 896 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 IDI2Q9BXS1 227 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 KRT23Q9C075 422 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 B4E1Z4 1266 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 WNT10BO00744 389 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 EGFRP00533 1210 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 SLC4A3P48751 1232 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 AK2P54819 239 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 TCP10Q12799 353 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 MCM5P33992 734 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 PLCD1P51178 756 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 CHST3Q7LGC8 479 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 GLTPD2A6NH11 291 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 MCM2P49736 904 aa25.85■■□□□ 1.73
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