RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.541e-10■■■■■ 44.1
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SH3BP4-201ENST00000344528 USP17L21D6R901 530 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 PDE6AP16499 860 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 LMAN1P49257 510 aa18.35■□□□□ 0.53
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SH3BP4-201ENST00000344528 USP40Q9NVE5 1235 aa18.35■□□□□ 0.53
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SH3BP4-201ENST00000344528 CEP112Q8N8E3 955 aa18.34■□□□□ 0.53
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SH3BP4-201ENST00000344528 RGS22Q8NE09 1264 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 FNBP1Q96RU3 617 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 COMMD10Q9Y6G5 202 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 ERICH4A6NGS2 130 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 DYNC1I1O14576 645 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF654Q8IZM8 581 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4-201ENST00000344528 ASAP1Q9ULH1 1129 aa18.33■□□□□ 0.53
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