RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301730.12

RNPS1-201, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,276 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-201ENST00000301730 SMC5Q8IY18 1101 aa25.09■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.09■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.615e-8■■□□□ 11.6
RNPS1-201ENST00000301730 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 IGHDP01880 384 aa25.08■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 PDE6AP16499 860 aa25.08■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 DCAF15Q66K64 600 aa25.08■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 MYH7P12883 1935 aa25.08■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.07■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.07■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.07■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.07■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 CSRNP1Q96S65 589 aa25.07■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.07■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.07■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 MAP3K9P80192 1104 aa25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 LAMB1P07942 1786 aa25.05■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.05■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 VGLL4Q14135 290 aa25.05■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 SPRYD7Q5W111 196 aa25.05■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 CERS3Q8IU89 383 aa25.05■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 WRNIP1Q96S55 665 aa25.05■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.05■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 FOXN1O15353 648 aa25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 MX1P20591 662 aa25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 AIDAQ96BJ3 306 aa25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 WNK4Q96J92 1243 aa25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 ADD2P35612 726 aa25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 ELP3Q9H9T3 547 aa25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 CSADQ9Y600 493 aa25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 FLT1P17948 1338 aa25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 ERC2O15083 957 aa25.02■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 MAP3K10Q02779 954 aa25.02■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.02■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.02■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.02■■□□□ 1.6
RNPS1-201ENST00000301730 SIPA1L1O43166 1804 aa25.01■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.01■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 GJA5P36382 358 aa25.01■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 SLURP2P0DP57 97 aa25■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 INPP5BP32019 993 aa25■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 SLFNL1Q499Z3 407 aa25■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 LNPKQ9C0E8 428 aa25■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 CHGBP05060 677 aa24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 UBE3CQ15386 1083 aa24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 OPTNQ96CV9 577 aa24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 STAP2Q9UGK3 403 aa24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 MYH1P12882 1939 aa24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 CA12O43570 354 aa24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 TBC1D12O60347 775 aa24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 NUCB1Q02818 461 aa24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 USP5P45974 858 aa24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 TM4SF4P48230 202 aa24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 PDE1AP54750 535 aa24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 SREBF2Q12772 1141 aa24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 NAV1Q8NEY1 1877 aa24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 FAM196BA6NMK8 535 aa24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 ERO1BQ86YB8 467 aa24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 LCORLQ8N3X6 602 aa24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 OTUD5Q96G74 571 aa24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 PALD1Q9ULE6 856 aa24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-201ENST00000301730 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
RNPS1-201ENST00000301730 ARMT1Q9H993 441 aa24.95■■□□□ 1.58
RNPS1-201ENST00000301730 RNF186Q9NXI6 227 aa24.95■■□□□ 1.58
RNPS1-201ENST00000301730 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.95■■□□□ 1.58
RNPS1-201ENST00000301730 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
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