RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 GSTO1P78417 241 aa23.86■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 DACT2Q5SW24 774 aa23.86■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 RNF20Q5VTR2 975 aa23.86■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 USP17L3A6NCW0 530 aa23.86■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 USP17L4A6NCW7 530 aa23.86■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 FGAP02671 866 aa23.86■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 CYP21A2P08686 494 aa23.86■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.414e-7■■□□□ 12.5
UBE2B-201ENST00000265339 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.86■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.86■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.85■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 APPP05067 770 aa23.85■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.85■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 SYT17Q9BSW7 474 aa23.85■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.85■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.84■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 F8W031 263 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 GNAT2P19087 354 aa23.84■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.84■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 TSPY26PQ9H489 355 aa23.84■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 TMX3Q96JJ7 454 aa23.84■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.84■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.83■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 RASSF7Q02833 373 aa23.83■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 LAMA4Q16363 1823 aa23.83■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.83■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.83■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
UBE2B-201ENST00000265339 LDHCP07864 332 aa23.82■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 NIM1KQ8IY84 436 aa23.82■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 GAKO14976 1311 aa23.82■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.82■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.82■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.82■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 ZMYM6O95789 1325 aa23.81■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 MBD3O95983 291 aa23.81■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 ALX1Q15699 326 aa23.81■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 PRELPP51888 382 aa23.8■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 HAND2P61296 217 aa23.8■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 SLF2Q8IX21 1173 aa23.8■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.8■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 RAD17O75943 681 aa23.8■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 BTDP43251 543 aa23.8■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 SCNN1DP51172 638 aa23.8■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.8■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.8■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.79■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 CASTP20810 708 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 PPP4CP60510 307 aa23.79■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.79■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 NAPBQ9H115 298 aa23.79■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.79■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 BAG3O95817 575 aa23.78■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 CPA1P15085 419 aa23.78■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.78■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.78■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 PSMD14O00487 310 aa23.78■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 TDO2P48775 406 aa23.78■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 NBPF3Q9H094 633 aa23.78■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 KRT32Q14532 448 aa23.77■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.77■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM51Q9NW97 253 aa23.77■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF213O14771 459 aa23.77■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.49e-7■■■■□ 19.7
UBE2B-201ENST00000265339 JDP2Q8WYK2 163 aa23.77■■□□□ 1.4
UBE2B-201ENST00000265339 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
UBE2B-201ENST00000265339 UTRNP46939 3433 aa23.76■■□□□ 1.39
UBE2B-201ENST00000265339 E7EWF7 191 aa23.76■■□□□ 1.39
UBE2B-201ENST00000265339 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
UBE2B-201ENST00000265339 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
UBE2B-201ENST00000265339 PSMA5P28066 241 aa23.75■■□□□ 1.39
UBE2B-201ENST00000265339 TEKT1Q969V4 418 aa23.75■■□□□ 1.39
UBE2B-201ENST00000265339 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
UBE2B-201ENST00000265339 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.75■■□□□ 1.39
UBE2B-201ENST00000265339 CRKP46108 304 aa23.75■■□□□ 1.39
UBE2B-201ENST00000265339 RHBDL3P58872 404 aa23.75■■□□□ 1.39
UBE2B-201ENST00000265339 CXCL9Q07325 125 aa23.75■■□□□ 1.39
UBE2B-201ENST00000265339 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.75■■□□□ 1.39
UBE2B-201ENST00000265339 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
UBE2B-201ENST00000265339 USP25Q9UHP3 1055 aa23.75■■□□□ 1.39
UBE2B-201ENST00000265339 NAV1Q8NEY1 1877 aa23.74■■□□□ 1.39
UBE2B-201ENST00000265339 BRD1O95696 1058 aa23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms