RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.22■□□□□ 0.99
USP18-201ENST00000215794 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.22■□□□□ 0.99
USP18-201ENST00000215794 SP8Q8IXZ3 490 aa21.22■□□□□ 0.99
USP18-201ENST00000215794 NAPBQ9H115 298 aa21.22■□□□□ 0.99
USP18-201ENST00000215794 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
USP18-201ENST00000215794 RXRAP19793 462 aa21.21■□□□□ 0.99
USP18-201ENST00000215794 ALX1Q15699 326 aa21.21■□□□□ 0.99
USP18-201ENST00000215794 CAMK4Q16566 473 aa21.21■□□□□ 0.99
USP18-201ENST00000215794 CNKSR1Q969H4 720 aa21.21■□□□□ 0.99
USP18-201ENST00000215794 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
USP18-201ENST00000215794 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.2■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 UBE4AQ14139 1066 aa21.2■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 ABCF2Q9UG63 623 aa21.2■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 C6orf229H3BNL8 230 aa21.2■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.2■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 DACT1Q9NYF0 836 aa21.2■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 JAG2Q9Y219 1238 aa21.2■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.2■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 ZMYM6O95789 1325 aa21.19■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 TTLL6Q8N841 843 aa21.19■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.19■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 GGA1Q9UJY5 639 aa21.19■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.19■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 LTBP1Q14766 1721 aa21.19■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 RIMBP2O15034 1052 aa21.19■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 USP28Q96RU2 1077 aa21.19■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.19■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 CFAP45Q9UL16 551 aa21.19■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 CHD4Q14839 1912 aa21.19■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 CYP7A1P22680 504 aa21.18■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.18■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 BICD2Q8TD16 824 aa21.18■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 CPLX1O14810 134 aa21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 NR1I2O75469 434 aa21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 TDO2P48775 406 aa21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 TGFB2P61812 414 aa21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 MPNDQ8N594 471 aa21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 KDM4AO75164 1064 aa21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 CLCN1P35523 988 aa21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 VPS37DQ86XT2 251 aa21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 RAI14Q9P0K7 980 aa21.17■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 APOA5Q6Q788 366 aa21.16■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 C8orf76Q96K31 380 aa21.16■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 MYL10Q9BUA6 226 aa21.16■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 LY9Q9HBG7 655 aa21.16■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.16■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.16■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 CDC27P30260 824 aa21.16■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.16■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 MICU3Q86XE3 530 aa21.16■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.16■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.16■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.16■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 PIM2Q9P1W9 311 aa21.16■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.16■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.15■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 TMC4Q7Z404 712 aa21.15■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 SOCS7O14512 581 aa21.14■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 GNAT2P19087 354 aa21.14■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 ATP2B4P23634 1241 aa21.14■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 MAP3K11Q16584 847 aa21.14■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.14■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 TMEM87BQ96K49 555 aa21.14■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 AIFM3Q96NN9 605 aa21.14■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 USP25Q9UHP3 1055 aa21.14■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.14■□□□□ 0.98
USP18-201ENST00000215794 SMIM22K7EJ46 135 aa21.14■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.14■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.14■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 TNMDQ9H2S6 317 aa21.14■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.14■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 BCS1LQ9Y276 419 aa21.14■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.13■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.13■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.13■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 ZNF384Q8TF68 577 aa21.13■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.13■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.13■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 TOMM22Q9NS69 142 aa21.13■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 UVSSAQ2YD98 709 aa21.13■□□□□ 0.97
USP18-201ENST00000215794 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms