RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000189207.1

Gm28254-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm28254, Length 2,166 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28254-201ENSMUST00000189207 AtripQ8BMG1 785 aa9.29□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Ncaph2Q8BSP2 607 aa9.29□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Ttc19Q8CC21 365 aa9.29□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Rnf112Q96DY5 654 aa9.29□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Psmd6Q99JI4 389 aa9.29□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 4930550L24RikQ99PA7 320 aa9.29□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Ddx25Q9QY15 484 aa9.29□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Bicdl1A0JNT9 577 aa9.28□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Pfkfb3A7UAK5 555 aa9.28□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Trim34bJ3QNR8 485 aa9.28□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Birc3O08863 600 aa9.28□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Actn3O88990 900 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa9.28□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Foxd1Q61345 456 aa9.28□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Slf2Q6P9P0 1278 aa9.28□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Ccdc93Q7TQK5 629 aa9.28□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Clec16aQ80U30 1036 aa9.28□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Wdr35Q8BND3 1181 aa9.28□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Rmdn2Q8BSE0 410 aa9.28□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Trim34aQ99PP6 485 aa9.28□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Srfbp1Q9CZ91 441 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gcc1Q9D4H2 778 aa9.28□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Mkrn1Q9QXP6 481 aa9.28□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 A0A1W2P7S8 802 aa9.27□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 5830473C10RikF8VQ07 620 aa9.27□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Neurod6P48986 337 aa9.27□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Cplx2P84086 134 aa9.27□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 L1td1Q587J6 782 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Sh3gl1Q62419 368 aa9.27□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 4921504E06RikQ8CET2 560 aa9.27□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Abcg4Q91WA9 646 aa9.27□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Tuba8Q9JJZ2 449 aa9.27□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Tnfrsf10bQ9QZM4 381 aa9.27□□□□□ -0.92
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Bpifb4A2BGH0 617 aa9.27□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Myd88P22366 296 aa9.27□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Shank3Q4ACU6 1730 aa9.27□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Fhod1Q6P9Q4 1197 aa9.27□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Spon1Q8VCC9 807 aa9.27□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Luc7lQ9CYI4 371 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Armc9Q9D2I5 817 aa9.27□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Osbpl5Q9ER64 874 aa9.27□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 PyglQ9ET01 850 aa9.27□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Tpd52l1O54818 204 aa9.26□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Cdk4P30285 303 aa9.26□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 CastP51125 788 aa9.26□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 XpcP51612 930 aa9.26□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Rgl2Q61193 778 aa9.26□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Mysm1Q69Z66 819 aa9.26□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Wdr44Q6NVE8 915 aa9.26□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Sumf1Q8R0F3 372 aa9.26□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Spats2lQ91WJ7 558 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 BcamQ9R069 622 aa9.26□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Pet2A2AHY8 747 aa9.26□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Ppfia3P60469 1194 aa9.26□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 MmeQ61391 750 aa9.26□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Ripor2Q80U16 1078 aa9.26□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa9.26□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Plcb4Q91UZ1 1175 aa9.26□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Cyp2c69E9PXC3 491 aa9.25□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 H2afxP27661 143 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Cyp2c40P56657 491 aa9.25□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Nbr1P97432 988 aa9.25□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Znhit6Q3UFB2 460 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Stip1Q60864 543 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Tpp2Q64514 1262 aa9.25□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Skida1Q80YR3 822 aa9.25□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Bbs9Q811G0 885 aa9.25□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 ThemisQ8BGW0 636 aa9.25□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Camkk2Q8C078 588 aa9.25□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Eva1bQ8K2Y3 164 aa9.25□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 SrrtQ99MR6 875 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Klc4Q9DBS5 619 aa9.25□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Scgb2b7D3YYY1 112 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Trim38Q5SZ99 471 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 FntaQ61239 377 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Atad2Q8CDM1 1040 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gimap3Q99MI6 301 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Tpgs1Q99MS8 303 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Tmed5Q9CXE7 229 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Tlr9Q9EQU3 1032 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Tsga10Q6NY15 697 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Baiap3Q80TT2 1134 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Kif2bQ8C0N1 668 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 SnrkQ8VDU5 748 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Dbr1Q923B1 550 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 NwcQ9CQI4 244 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Lonp2Q9DBN5 852 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Sned1Q70E20 1403 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Btn2a2A4QPC6 514 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.4 ms