RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042824.12

Herc1-201, Transcript of HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Herc1, Length 15,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1-201ENSMUST00000042824 NapaQ9DB05 295 aa6.6□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 A0A0U1RNP2 1173 aa6.6□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Snap23O09044 210 aa6.6□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rbm43Q99J64 343 aa6.6□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Nlrp5Q9R1M5 1163 aa6.6□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 ItpripQ3TNL8 555 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Skap1Q3UUV5 355 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Terf2ipQ91VL8 393 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Stk32bQ9JJX8 414 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccdc121E9Q6D3 323 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm5592Q3V0A6 857 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Maip1Q8BHE8 291 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Znf526Q8BI66 675 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fam114a1Q9D281 569 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Usp32F8VPZ3 1604 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Med23Q80YQ2 1367 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Esr2O08537 530 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Eya3P97480 510 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Usp25P57080 1055 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ano2Q8CFW1 1002 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Taf5lQ91WQ5 589 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 CenphQ9QYM8 241 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 GabrdP22933 449 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 FanccP50652 591 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ift122Q6NWV3 1182 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Popdc2Q9ES82 367 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gdf11Q9Z1W4 405 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Flt1P35969 1333 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Stat5bP42232 786 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Q9D5Q8 446 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 AdpgkQ8VDL4 496 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zbtb21E9Q444 1094 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 LdhbP16125 334 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 EgfrQ01279 1210 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Large2Q5XPT3 690 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa6.59□□□□□ -1.35
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ano3A2AHL1 981 aa6.59□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Nfil3O08750 462 aa6.59□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ftl1P29391 183 aa6.59□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lmbrd2Q8C561 694 aa6.59□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Stn1Q8K2X3 378 aa6.59□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 SdsQ8VBT2 327 aa6.59□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hs6st3Q9QYK4 470 aa6.59□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cdcp1Q5U462 833 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dcaf15Q6PFH3 600 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Znf131Q8K3J5 619 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Serpinb3bQ9D1Q5 387 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Trappc10Q3TLI0 1259 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Iqsec2Q5DU25 1478 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 NkapQ9D0F4 415 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tmod4Q9JLH8 345 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Znf394Q9Z1D9 521 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Clec11aO88200 328 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Jakmip3Q5DTN8 844 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Prss51A0A286YDY8 319 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Col4a3bpQ9EQG9 624 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cfap73J3QPZ5 306 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Serpinc1P32261 465 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Nop2Q922K7 793 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 PigbQ9JJQ0 542 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Usp14Q9JMA1 493 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rrp1P56183 494 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Neurog2P70447 263 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cd2bp2Q9CWK3 342 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Krt13P08730 437 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Myl3P09542 204 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Wdr93Q402B2 695 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tceanc2Q8R2M0 207 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccdc105Q9D4K7 499 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Znf541Q0GGX2 1363 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Psmc2P46471 433 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Clca2Q8BG22 942 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tmem179Q8BHH9 233 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Spata21Q8BHW6 681 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mknk2Q8CDB0 459 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Plcd1Q8R3B1 756 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ifi207E9Q3L4 978 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccdc174Q3U155 467 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Sun3Q5SS91 320 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Prm3Q62100 101 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mrpl11Q9CQF0 192 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cd274Q9EP73 290 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rcan1Q9JHG6 198 aa6.58□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 PplQ9R269 1755 aa6.57□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 SrprbP47758 269 aa6.57□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Paxbp1P58501 919 aa6.57□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ctnna2Q61301 953 aa6.57□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr118Q7TRJ6 321 aa6.57□□□□□ -1.36
Herc1-201ENSMUST00000042824 Klhl30Q8C3F7 581 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 71.4 ms