RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Senp6Q6P7W0 1132 aa23.61■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nutm1Q8BHP2 1126 aa23.61■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ift57Q8BXG3 429 aa23.61■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mov10l1Q99MV5 1187 aa23.61■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 GrapQ9CX99 217 aa23.61■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rbm6S4R1W5 1118 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa23.6■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ets1P27577 440 aa23.6■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eif5P59325 429 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Traf7Q922B6 594 aa23.6■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tceal9Q9DD24 104 aa23.6■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trim5E9PV98 497 aa23.59■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc27a3O88561 667 aa23.59■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 ThbdP15306 577 aa23.59■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Igfbp4P47879 254 aa23.59■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cdcp1Q5U462 833 aa23.59■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Med23Q80YQ2 1367 aa23.59■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Has3O08650 554 aa23.58■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Timm10P62073 90 aa23.58■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf330Q922H9 316 aa23.58■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zbed3Q9D0L1 228 aa23.58■■□□□ 1.37
Ltb-201ENSMUST00000025262 Igsf9bE9PZ19 1328 aa23.58■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tuft1O08970 390 aa23.57■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ube2q1Q7TSS2 422 aa23.57■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ttc7aQ8BGB2 858 aa23.57■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa23.57■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lamp1P11438 406 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Klhdc9Q3USL1 350 aa23.56■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Acap3Q6NXL5 833 aa23.56■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam205a1D3YZF6 1314 aa23.56■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nphp3Q7TNH6 1325 aa23.56■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mms22lB1AUR6 1238 aa23.55■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 B020004C17RikJ3QP07 232 aa23.55■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cntnap5bQ0V8T8 1292 aa23.55■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 PaoxQ8C0L6 504 aa23.55■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Stat5bP42232 786 aa23.54■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccdc84Q4VA36 332 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa23.54■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fsd2Q8BZ52 692 aa23.54■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Piezo1E2JF22 2547 aa23.54■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 MycP01108 439 aa23.53■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sv2cQ69ZS6 727 aa23.53■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ube3cQ80U95 1083 aa23.53■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Btnl4A2CG29 586 aa23.52■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 CalcaP70160 136 aa23.52■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pcgf6Q99NA9 353 aa23.52■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ngly1Q9JI78 651 aa23.52■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Epb41l3Q9WV92 929 aa23.52■■□□□ 1.36
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cspp1B2RX88 1205 aa23.51■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 NcanP55066 1268 aa23.51■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam83hQ148V8 1209 aa23.51■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa23.51■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pof1bQ8K4L4 587 aa23.51■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Disp2Q8CIP5 1345 aa23.51■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lama3Q61789 3330 aa23.5■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Palm3A2TJV2 734 aa23.5■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 DaxxO35613 739 aa23.5■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 GclcP97494 637 aa23.5■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fndc3bQ6NWW9 1207 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Smc1bQ920F6 1248 aa23.5■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sbno2Q7TNB8 1349 aa23.5■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp2c39P56656 490 aa23.49■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dcaf15Q6PFH3 600 aa23.49■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ero1aQ8R180 464 aa23.49■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 SktA2AQ25 1946 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Plxnb2B2RXS4 1842 aa23.48■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nim1kQ8BHI9 436 aa23.48■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Calhm4Q8CE93 315 aa23.48■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sbf1Q6ZPE2 1867 aa23.47■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm9857F7CXR1 130 aa23.47■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 TsksO54887 585 aa23.47■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atp9bP98195 1146 aa23.47■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 1700018B08RikQ9DA83 213 aa23.47■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Frmpd4A2AFR3 1320 aa23.47■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Col20a1Q923P0 1320 aa23.47■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 DcxO88809 366 aa23.46■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc4a1P04919 929 aa23.46■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Morf4l1P60762 362 aa23.46■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nlrp9aQ66X03 949 aa23.46■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa23.46■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trim32Q8CH72 655 aa23.46■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tjap1Q9DCD5 539 aa23.46■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 PfkpQ9WUA3 784 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tsc2Q61037 1814 aa23.45■■□□□ 1.34
Ltb-201ENSMUST00000025262 Adgra3Q7TT36 1310 aa23.45■■□□□ 1.34
Ltb-201ENSMUST00000025262 RptorQ8K4Q0 1335 aa23.45■■□□□ 1.34
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam102bQ8BQS4 339 aa23.45■■□□□ 1.34
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pramef17A2ASJ1 475 aa23.44■■□□□ 1.34
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ier5O89113 308 aa23.44■■□□□ 1.34
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prl7d1P04769 244 aa23.44■■□□□ 1.34
Ltb-201ENSMUST00000025262 Neurod6P48986 337 aa23.44■■□□□ 1.34
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