RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	KRTAP10-3	P60369	221 aa		6	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		6	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	PCP2	Q8IVA1	136 aa		6	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		6	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		6	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	COX11	Q9Y6N1	276 aa		6	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	MTOR	P42345	2549 aa		6	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501		H3BRM9	83 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	UBE2L6	O14933	153 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501		P0DMU3	169 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	FAM231A	P0DMU4	169 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	FAM231C	P0DMU5	169 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	TCTA	P57738	103 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501		Q6ZTI0	123 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	TMEM101	Q96IK0	257 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	HIST1H4G	Q99525	98 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	NF1	P21359	2839 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	SORL1	Q92673	2214 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	GAGE12B	A1L429	117 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF815P	A8K554	130 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	LYRM9	A8MSI8	78 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	GAGE7	O76087	117 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	GAGE12F	P0CL80	117 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	GAGE12G	P0CL81	117 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	GAGE12I	P0CL82	117 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	SMIM13	P0DJ93	91 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	GCSH	P23434	173 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF479	Q96JC4	524 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	LEPROT	O15243	131 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	PRM2	P04554	102 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	VAMP3	Q15836	100 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	CEND1	Q8N111	149 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	AMELX	Q99217	191 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	TM2D2	Q9BX73	214 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501		J3QQQ9	107 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	WIPF1	O43516	503 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	UBE2D3	P61077	147 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	UBE2D2	P62837	147 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	5.96	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501		Q6ZSN1	163 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	TMEM243	Q9BU79	118 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		5.96	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	TMEM223	A0PJW6	202 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	GAGE12J	A6NER3	117 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	TAX1BP3	O14907	124 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	MIF	P14174	115 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	HERVK_113	P63121	156 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	GAGE4	Q13068	117 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	GAGE5	Q13069	117 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	UBE2V1	Q13404	147 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	GAGE13	Q4V321	117 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	NACA	E9PAV3	2078 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	C9orf118	A6NHY6	69 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	TMEM238	C9JI98	176 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	EMP1	P54849	157 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	TIRAP	P58753	221 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	C3orf56	Q8N813	242 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	COPS9	Q8WXC6	57 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501		A0A0J9YXV3	536 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	DEFB130B	P0DP73	79 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	DEFB130A	P0DP74	79 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PNKP-231	ENST00000640501	FABP2	P12104	132 aa		5.93	□□□□□ -1.46

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