RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA25Q9BR10 227 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 P0DMU3 169 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM231AP0DMU4 169 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM231CP0DMU5 169 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 FHL2Q14192 279 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 TIMM17AQ99595 171 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC01545Q5VT33 79 aa16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00173Q6ZV60 143 aa16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB121Q5J5C9 76 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 C20orf203Q8NBC4 194 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 GAGE12JA6NER3 117 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2D3P61077 147 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2D2P62837 147 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 GAGE1Q13065 139 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 GAGE4Q13068 117 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 GAGE5Q13069 117 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 GAGE13Q4V321 117 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 GTSF1LQ9H1H1 148 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 PKIAP61925 76 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 SH2D6Q7Z4S9 175 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 ZMAT4Q9H898 229 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 NACAE9PAV3 2078 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 SPANXA1Q9NS26 97 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 PAX4O43316 350 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 PLNP26678 52 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 CRYBA4P53673 196 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 Q8N976 141 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-212ENST00000591041 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa16.02■□□□□ 0.16
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CAPNS1-212ENST00000591041 A0A087WX48 190 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 H7C423 109 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 DPM2O94777 84 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa15.99■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 K7EIL1 84 aa15.99■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2L6O14933 153 aa15.99■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa15.99■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 CMYA5Q8N3K9 4069 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 IGIPA6NJ69 53 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 PMVKQ15126 192 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 TIMM21Q9BVV7 248 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 F5H768 121 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKCP01834 107 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 GYPEP15421 78 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM243Q9BU79 118 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 VCX2Q9H322 139 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 PAM16Q9Y3D7 125 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 F8VRH5 84 aa15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 ODF1Q14990 250 aa15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA45Q537H7 98 aa15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 BAALCQ8WXS3 180 aa15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM101Q96IK0 257 aa15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL39P62891 51 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 TM2D3Q9BRN9 247 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 C2orf88Q9BSF0 95 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 RETNQ9HD89 108 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 SBSPONQ8IVN8 264 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 ATOH7Q8N100 152 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 CHCHD7Q9BUK0 85 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 CELA1Q9UNI1 258 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 CDPF1Q6NVV7 123 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 ICOSQ9Y6W8 199 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 PCP4L1A6NKN8 68 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 H3BNG1 76 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 HTN3P15516 51 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF664Q8N3J9 261 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 C11orf45Q8TAV5 145 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 Q9UF83 564 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 PRSS29PA6NIE9 313 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00694P0DN24 101 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 C12orf74Q32Q52 190 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 MRAPQ8TCY5 172 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 PMCHL2Q9BQD1 86 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 CST9LQ9H4G1 147 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0J9YWU9 116 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 HERVK_113P61574 105 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 OR5A1Q8NGJ0 315 aa15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
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