RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ENHOQ6UWT2 76 aa16.08■□□□□ 0.17
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa16.08■□□□□ 0.17
PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZTI0 123 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 ODF3Q96PU9 254 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 NOTCH3Q9UM47 2321 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC179H3BU77 68 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 SEC61GP60059 68 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00467Q9BRT7 94 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 LMO4P61968 165 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 IGF1P05019 195 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 NBASA2RRP1 2371 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 MBD6Q96DN6 1003 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 CACNA1HO95180 2353 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 CLUHP3Q96NS8 147 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 C2orf16Q68DN1 1984 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM131Q92545 1883 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00269Q8N2A0 174 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 YPEL4Q96NS1 127 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM223A0PJW6 202 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 H0Y9J4 135 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 TRIAP1O43715 76 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa16.03■□□□□ 0.16
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PTPRM-211ENST00000580170 INSL3P51460 131 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 SERP2Q8N6R1 65 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRM-211ENST00000580170 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.163e-7■■■□□ 18.6
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PTPRM-211ENST00000580170 REG3AQ06141 175 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRM-211ENST00000580170 SCXQ7RTU7 201 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRM-211ENST00000580170 K7EQG2 157 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRM-211ENST00000580170 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa16■□□□□ 0.15
PTPRM-211ENST00000580170 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf195Q5TG92 126 aa16■□□□□ 0.15
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa16■□□□□ 0.15
PTPRM-211ENST00000580170 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa16■□□□□ 0.15
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PTPRM-211ENST00000580170 C22orf34Q6ZV56 151 aa16■□□□□ 0.15
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PTPRM-211ENST00000580170 U3KQK5 164 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV4-1P06312 121 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRM-211ENST00000580170 RNF185Q96GF1 192 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRM-211ENST00000580170 C19orf84I3L1E1 186 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRM-211ENST00000580170 XGP55808 180 aa15.98■□□□□ 0.15
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PTPRM-211ENST00000580170 NDUFC1O43677 76 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L23D6RBM5 183 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP126Q5VTH2 177 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 FAM222AQ5U5X8 452 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 C2orf91Q6ZV80 131 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 TIMM17BO60830 172 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00308Q8TCZ7 52 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 M0QY20 66 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa15.94■□□□□ 0.14
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PTPRM-211ENST00000580170 C4orf48Q5BLP8 95 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 C11orf45Q8TAV5 145 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00694P0DN24 101 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV4-31P0DP07 118 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 MED13LQ71F56 2210 aa15.92■□□□□ 0.14
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PTPRM-211ENST00000580170 IGLV2-11P01706 119 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 LYRM9A8MSI8 78 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 EBI3Q14213 229 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 PROK1P58294 105 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 FSTL3O95633 263 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 PCNX2A6NKB5 2137 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 LTBP2Q14767 1821 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 NUP210LQ5VU65 1888 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRM-211ENST00000580170 HIGD2AQ9BW72 106 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRM-211ENST00000580170 SMIM9A6NGZ8 99 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRM-211ENST00000580170 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRM-211ENST00000580170 HRCT1Q6UXD1 115 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRM-211ENST00000580170 FREM1Q5H8C1 2179 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRM-211ENST00000580170 ALPK3Q96L96 1907 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRM-211ENST00000580170 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRM-211ENST00000580170 A6NED7 52 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRM-211ENST00000580170 PRORYQ9H606 182 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRM-211ENST00000580170 C10orf99Q6UWK7 81 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRM-211ENST00000580170 CRYGDP07320 174 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRM-211ENST00000580170 C14orf177Q52M58 125 aa15.85■□□□□ 0.13
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