RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568631.5

RNPS1-223, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-223	ENST00000568631	NUDT3	O95989	172 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	G0S2	P27469	103 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	TENM3	Q9P273	2699 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	HBD	P02042	147 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A096LNJ9	63 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	FABP4	P15090	132 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	LINC01549	A6NIU2	74 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	LEPROTL1	O95214	131 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A096LPF7	62 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	AKR1D1	P51857	326 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	TOMM6	Q96B49	74 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	ATP5L	O75964	103 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	SMIM6	P0DI80	62 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM243	Q9BU79	118 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631		H7C423	109 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	ERAS	Q7Z444	233 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	IGLL5	B9A064	214 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	UBE2L6	O14933	153 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	TIRAP	P58753	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM141	Q96I45	108 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	TIMM17A	Q99595	171 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	IGIP	A6NJ69	53 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTDAP	P60985	99 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	LELP1	Q5T871	98 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	NUPR2	A6NF83	97 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	PYY3	Q5JQD4	70 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	C12orf57	Q99622	126 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	NPS	P0C0P6	89 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	C3orf79	P0CE67	100 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	FGF6	P10767	208 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631		Q6ZN92	141 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	PRSS1	P07477	247 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	GAGE6	Q13070	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	COL7A1	Q02388	2944 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	PKIA	P61925	76 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	ESRG	Q1W209	222 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	PET117	Q6UWS5	81 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM101	Q96IK0	257 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM262	E9PQX1	116 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631		H0Y8G0	127 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	BAALC	Q8WXS3	180 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	VCX2	Q9H322	139 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A1B0GUV1	79 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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