RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-212ENST00000541770 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-212ENST00000541770 SIVA1O15304 175 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 CAMPP49913 170 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 AMN1Q8IY45 258 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 MRAP2Q96G30 205 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 K7EP13 123 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 PPP1R17O96001 155 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.87□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 GCSHP23434 173 aa5.87□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.87□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.87□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A087WTM6 91 aa5.86□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.86□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 COLCA2A8K830 154 aa5.86□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 PPBPP02775 128 aa5.86□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 ELOBQ15370 118 aa5.86□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.86□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 PHOX2AO14813 284 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 GAS8-AS1O95177 125 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 RAB5AP20339 215 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 IQCJQ1A5X6 159 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 COX19Q49B96 90 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 NFE4Q86UQ8 179 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 NRACQ8N912 160 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 YPEL4Q96NS1 127 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 ST20Q9HBF5 79 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 FAT1Q14517 4588 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 SMKR1H3BMG3 65 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 NCR2O95944 276 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 CKS2P33552 79 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 PKIAP61925 76 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 COTL1Q14019 142 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 NIT1Q86X76 327 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 C20orf78Q9BR46 151 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-212ENST00000541770 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 D6R8Y8 96 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 I3L3M4 83 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 HLA-DQA1P01909 254 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 ORMDL3Q8N138 153 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 PRSS47A8MTI9 375 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 VCYO14598 125 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 TNFRSF6BO95407 300 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 MT-ND6P03923 174 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 PMCHP20382 165 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 LAGE3Q14657 143 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 PRELID3AQ96N28 172 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM243Q9BU79 118 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 MYCBP2O75592 4640 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A087WX48 190 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 H7C423 109 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 TCAPO15273 167 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 PSCAO43653 123 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 NPYP01303 97 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV3-30P01768 117 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV3-33P01772 117 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 APCSP02743 223 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 AMTP48728 403 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 RAB5BP61020 215 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 KIR2DL4Q99706 377 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A1B0GUV1 79 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM262E9PQX1 116 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 TSHBP01222 138 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-212ENST00000541770 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
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