RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 DOCK1Q14185 1865 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLLU1Q5K131 121 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC37A2A6NM11 1700 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMIM24O75264 130 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC01545Q5VT33 79 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 DEFB123Q8N688 67 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC115Q96NT0 180 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1W2PRE2 83 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 A6NIN4 97 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM78Q5T7P6 136 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAFIPQ8WZ33 124 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYH8P13535 1937 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 CUBNO60494 3623 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC37A3O60309 1634 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 IFNA17P01571 189 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 HLA-DRB4P13762 266 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCL18P55774 89 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q6JHZ5 121 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 KNL1Q8NG31 2342 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 BANF2Q9H503 90 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 R4GMQ9 66 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZZEF1O43149 2961 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 M0R135 149 aa-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAEPP09466 180 aa-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 STOML2Q9UJZ1 356 aa-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYNMO15061 1565 aa-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAPVD1Q14C86 1478 aa-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 MT-ND4LP03901 98 aa-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIRTP0C851 137 aa-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNAH2Q9P225 4427 aa-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 NSD3Q9BZ95 1437 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP1R17O96001 155 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 BOLA2Q9H3K6 86 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF236Q9UL36 1845 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 DPM2O94777 84 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBE2G1P62253 170 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERCC6Q03468 1493 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRDM2Q13029 1718 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 AKAP13Q12802 2813 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 NCR2O95944 276 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 VSTM2AQ8TAG5 236 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 DMXL1Q9Y485 3027 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 KALRNO60229 2985 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYH13Q9UKX3 1938 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 COX17Q14061 63 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM244Q5VVB8 128 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 PITX3O75364 302 aa-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR8I2Q8N0Y5 310 aa-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 APLNQ9ULZ1 77 aa-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 RYR2Q92736 4967 aa-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM35BQ8NCS4 154 aa-3.14□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 SBF2Q86WG5 1849 aa-3.14□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACACAQ13085 2346 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIQKQ629K1 86 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 MNS1Q8NEH6 495 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 GID8Q9NWU2 228 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATPIF1Q9UII2 106 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-3.16□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRC1P22897 1456 aa-3.16□□□□□ -2.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 IFNGP01579 166 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 MT1AP04731 61 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 COX8AP10176 69 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF213Q63HN8 5207 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 TEX15Q9BXT5 2789 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 LYSTQ99698 3801 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 MIC13Q5XKP0 118 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 DAPK1P53355 1430 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHMP6Q96FZ7 201 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 V9GYH0 126 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGEF10O15013 1369 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 CBLN1P23435 193 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 SAMD13Q5VXD3 122 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 C9orf62Q8N4C0 152 aa-3.21□□□□□ -2.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms