RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489537.5

SF3A3-208, Transcript of splicing factor 3a subunit 3, human

TSL 4

Gene SF3A3, Length 891 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SF3A3-208	ENST00000489537	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	COX8A	P10176	69 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	AZU1	P20160	251 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	FXYD7	P58549	80 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	SEC11A	P67812	179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	PMVK	Q15126	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537		Q6ZQT7	251 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537		H7C423	109 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	IGLL1	P15814	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	COTL1	Q14019	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	ODF1	Q14990	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	TG	P01266	2768 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	GCSH	P23434	173 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	CTAG1A	P78358	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537		A6NDN8	102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537		K7EQD1	137 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	MIF	P14174	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	TAL2	Q16559	108 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	VCX2	Q9H322	139 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	JPT2	Q9H910	190 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SF3A3-208	ENST00000489537	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537		A8MZ25	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	SPRY2	O43597	315 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	HSD52	Q0P140	79 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537		E9PLD3	99 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537		H3BRM9	83 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	TSHB	P01222	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	NMU	P48645	174 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	UBE2L6	O14933	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	CCL25	O15444	150 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SF3A3-208	ENST00000489537	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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