RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442928.6

TRAF3IP2-AS1-205, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TMEM141Q96I45 108 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 RETNQ9HD89 108 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CELA1Q9UNI1 258 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NACAE9PAV3 2078 aa7.21□□□□□ -1.25
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 GAGE12JA6NER3 117 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 H3BNG1 76 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PAX4O43316 350 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SCGB1D1O95968 90 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 LINC00694P0DN24 101 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 GAGE1Q13065 139 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 GAGE4Q13068 117 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 GAGE5Q13069 117 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 C12orf74Q32Q52 190 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 GAGE13Q4V321 117 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MRAPQ8TCY5 172 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TIMM17AQ99595 171 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 B9D2Q9BPU9 175 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 Q9UF83 564 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 H7C423 109 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 C12orf57Q99622 126 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 A0A0J9YWU9 116 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 IGIPA6NJ69 53 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 F5H768 121 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PRSS1P07477 247 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 GYPEP15421 78 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 LINC01545Q5VT33 79 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 Q6ZN92 141 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 S100A12P80511 92 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 Q8N976 141 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 A0A087WX48 190 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TMEM243Q9BU79 118 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TIRAPP58753 221 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PKIAP61925 76 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PMVKQ15126 192 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 Q6ZTC4 211 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 BAALCQ8WXS3 180 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 A0A0J9YY99 117 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 UBE2L6O14933 153 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 HTN3P15516 51 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PLNP26678 52 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ODF1Q14990 250 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 VCX2Q9H322 139 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 F8VRH5 84 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 H0Y8G0 127 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 DPM2O94777 84 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TMEM101Q96IK0 257 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 AMELXQ99217 191 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 VAMP8Q9BV40 100 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CST9LQ9H4G1 147 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 A0A096LPF7 62 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 IGKCP01834 107 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 FGF6P10767 208 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.6 ms