RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 IGHV3-30P01768 117 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 NFE4Q86UQ8 179 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 DYNLRB2Q8TF09 96 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 A8MZ25 164 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 DEFB114Q30KQ6 69 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 C4orf3Q8WVX3 66 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 LINC01587Q99440 93 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 XCL2Q9UBD3 114 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 CFAP126Q5VTH2 177 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 RHODO00212 210 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.31□□□□□ -0.6
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NISCH-202ENST00000420808 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 VCX2Q9H322 139 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 M0R2P5 195 aa11.3□□□□□ -0.6
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NISCH-202ENST00000420808 RAX2Q96IS3 184 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
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NISCH-202ENST00000420808 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 GAGE13Q4V321 117 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 TRAV2A0A0B4J234 112 aa11.27□□□□□ -0.6
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NISCH-202ENST00000420808 PSMB2P49721 201 aa11.27□□□□□ -0.6
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NISCH-202ENST00000420808 LEPROTO15243 131 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 ZNF415Q09FC8 603 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 PTH2Q96A98 100 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 A4D1N5 150 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 A6NJY4 79 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 Q6ZUT4 128 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 WFDC10AQ9H1F0 79 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 A8MWV9 139 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 H7C2G1 150 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 IGHV3-53P01767 116 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
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NISCH-202ENST00000420808 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
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NISCH-202ENST00000420808 UBE2D2P62837 147 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
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NISCH-202ENST00000420808 A0A0J9YXY3 114 aa11.23□□□□□ -0.61
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NISCH-202ENST00000420808 EDA2RQ9HAV5 297 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 NDUFA7O95182 113 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 PLA2G2AP14555 144 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 GTSF1LQ9H1H1 148 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-202ENST00000420808 CCL24O00175 119 aa11.21□□□□□ -0.61
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NISCH-202ENST00000420808 LINC00694P0DN24 101 aa11.21□□□□□ -0.62
NISCH-202ENST00000420808 Q6ZTI0 123 aa11.21□□□□□ -0.62
NISCH-202ENST00000420808 STHQ8IWL8 128 aa11.21□□□□□ -0.62
NISCH-202ENST00000420808 LITAFQ99732 161 aa11.21□□□□□ -0.62
NISCH-202ENST00000420808 VWFP04275 2813 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-202ENST00000420808 PRO1854Q9UHT4 67 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-202ENST00000420808 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.2□□□□□ -0.62
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NISCH-202ENST00000420808 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-202ENST00000420808 RS1O15537 224 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-202ENST00000420808 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
NISCH-202ENST00000420808 COX6A2Q02221 97 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-202ENST00000420808 FHL3Q13643 280 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-202ENST00000420808 DAND5Q8N907 189 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP1-1Q07627 177 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-202ENST00000420808 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-202ENST00000420808 FASNP49327 2511 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
NISCH-202ENST00000420808 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
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