RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 IFITM2Q01629 132 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 WFDC2Q14508 124 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 AMN1Q8IY45 258 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 SDHAF1A6NFY7 115 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 LECT2O14960 151 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 AMTP48728 403 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00269Q8N2A0 174 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1B0GUV1 79 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 GCSHP23434 173 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 MRAP2Q96G30 205 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf43Q9BWL3 253 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 PRR34Q9NV39 138 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE2L6O14933 153 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 PMCHP20382 165 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 KRTAP10-1P60331 282 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 ST20Q9HBF5 79 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 I3L3M4 83 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 NCR2O95944 276 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 CAMPP49913 170 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 MIAQ16674 131 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 C20orf203Q8NBC4 194 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 APOBP04114 4563 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 HSPG2P98160 4391 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1B0GW15 77 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 CLPSL2Q6UWE3 100 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 SMKR1H3BMG3 65 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R2P9O14990 202 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS10P46783 165 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM104BQ5XKR9 115 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 REG3AQ06141 175 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM70Q9BUB7 260 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 APCSP02743 223 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R17O96001 155 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 H7C423 109 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 MT-ND4LP03901 98 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 HBBP68871 147 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 NRACQ8N912 160 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 ANAPC16Q96DE5 110 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 VCYO14598 125 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 TSHBP01222 138 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 S100A8P05109 93 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 UQCC3Q6UW78 93 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM242Q9NWH2 141 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1B0GXF2 115 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00862A6NCI5 91 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 F8W036 122 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 XGP55808 180 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 HLA-DQA1P01909 254 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 FGF6P10767 208 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 ESDP10768 282 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 CKS2P33552 79 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM218A2RU14 115 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 C14orf177Q52M58 125 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L23D6RBM5 183 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 Q8N1X5 172 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa13.8□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 FCER1GP30273 86 aa13.8□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM101Q96IK0 257 aa13.8□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 BTF3L4Q96K17 158 aa13.8□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 C20orf78Q9BR46 151 aa13.8□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 D6R8Y8 96 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFRSF6BO95407 300 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 ADCYAP1P18509 176 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 KIR2DL4Q99706 377 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM30AQ9NZY2 134 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC01620Q4KN68 170 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 C7orf77A4D0Y5 90 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 PPBPP02775 128 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 PRSS1P07477 247 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 COMMD7Q86VX2 200 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 OR5A1Q8NGJ0 315 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL32P62910 135 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM136Q6ZRR5 245 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 SEC11CQ9BY50 192 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAH8Q96JB1 4490 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 GAGE12HA6NDE8 117 aa13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms