RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 TSHBP01222 138 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 COTL1Q14019 142 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 FHL2Q14192 279 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 PRSS1P07477 247 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 EMP1P54849 157 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 UBE2D3P61077 147 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 PKIAP61925 76 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 UBE2D2P62837 147 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZN92 141 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 VAMP8Q9BV40 100 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 PRO0255Q9UI72 69 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 TENM2Q9NT68 2774 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 IGIPA6NJ69 53 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 TSTD3H0UI37 97 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 H7C423 109 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 P0DMU3 169 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 FAM231AP0DMU4 169 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 FAM231CP0DMU5 169 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB130BP0DP73 79 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB130AP0DP74 79 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 DAD1P61803 113 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 NACAE9PAV3 2078 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 A0A087WX48 190 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 ATP5G1P05496 136 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00694P0DN24 101 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 ODF1Q14990 250 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 SPATA25Q9BR10 227 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 F8VRH5 84 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 PLNP26678 52 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 PMVKQ15126 192 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 BAALCQ8WXS3 180 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 GAGE12JA6NER3 117 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 H0Y8G0 127 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 H3BNG1 76 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 K7EIL1 84 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 PAX4O43316 350 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 DPM2O94777 84 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 IGKCP01834 107 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 GAGE1Q13065 139 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 GAGE4Q13068 117 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 GAGE5Q13069 117 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 GAGE13Q4V321 117 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 SPATA45Q537H7 98 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 Q9UF83 564 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 C3orf84H3BNL1 204 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 CST9LQ9H4G1 147 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 GYPEP15421 78 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 AMELXQ99217 191 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM243Q9BU79 118 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 VCX2Q9H322 139 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 CELA1Q9UNI1 258 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB4AO15263 64 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 C12orf74Q32Q52 190 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
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