RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.7□□□□□ -1.02
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HDGFL3-201ENST00000299633 NPBQ8NG41 125 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-201ENST00000299633 IGHV3-30P01768 117 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-201ENST00000299633 IGHV3-33P01772 117 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-201ENST00000299633 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-201ENST00000299633 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-201ENST00000299633 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-201ENST00000299633 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.69□□□□□ -1.02
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HDGFL3-201ENST00000299633 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa8.68□□□□□ -1.02
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HDGFL3-201ENST00000299633 FHL1Q13642 323 aa8.68□□□□□ -1.02
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HDGFL3-201ENST00000299633 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.65□□□□□ -1.02
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HDGFL3-201ENST00000299633 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.63□□□□□ -1.03
HDGFL3-201ENST00000299633 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
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HDGFL3-201ENST00000299633 LY6HO94772 140 aa8.62□□□□□ -1.03
HDGFL3-201ENST00000299633 SLPIP03973 132 aa8.62□□□□□ -1.03
HDGFL3-201ENST00000299633 Q8N9W7 124 aa8.62□□□□□ -1.03
HDGFL3-201ENST00000299633 LIMD2Q9BT23 127 aa8.61□□□□□ -1.03
HDGFL3-201ENST00000299633 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.61□□□□□ -1.03
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HDGFL3-201ENST00000299633 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.61□□□□□ -1.03
HDGFL3-201ENST00000299633 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.61□□□□□ -1.03
HDGFL3-201ENST00000299633 MDFICQ9P1T7 246 aa8.61□□□□□ -1.03
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HDGFL3-201ENST00000299633 A8MZ25 164 aa8.6□□□□□ -1.03
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HDGFL3-201ENST00000299633 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HDGFL3-201ENST00000299633 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.57□□□□□ -1.04
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HDGFL3-201ENST00000299633 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.57□□□□□ -1.04
HDGFL3-201ENST00000299633 Q6JHZ5 121 aa8.57□□□□□ -1.04
HDGFL3-201ENST00000299633 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.56□□□□□ -1.04
HDGFL3-201ENST00000299633 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.56□□□□□ -1.04
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