RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa10.52□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 CIDEAO60543 219 aa10.52□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00694P0DN24 101 aa10.52□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 WDR73Q6P4I2 378 aa10.52□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 OR2D3Q8NGH3 330 aa10.52□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa10.52□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 PRADC1Q9BSG0 188 aa10.52□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa10.52□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa10.52□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 FAM231BA6NCW3 169 aa10.51□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 FAM162BQ5T6X4 162 aa10.51□□□□□ -0.73
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SPCS1-201ENST00000233025 RPS20P60866 119 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 RASL11AQ6T310 242 aa10.5□□□□□ -0.73
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SPCS1-201ENST00000233025 DPH3P1Q9H4G8 78 aa10.49□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 FABP5P3A8MUU1 101 aa10.48□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 HIGD1CA8MV81 97 aa10.48□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 PANO1I0J062 215 aa10.48□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 TRGC1P0CF51 173 aa10.48□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 RAB4BP61018 213 aa10.48□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 FABP9Q0Z7S8 132 aa10.48□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa10.48□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC30Q96LL9 226 aa10.48□□□□□ -0.73
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SPCS1-201ENST00000233025 SH2D1AO60880 128 aa10.47□□□□□ -0.73
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SPCS1-201ENST00000233025 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 UFSP1Q6NVU6 142 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 NUP35Q8NFH5 326 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 RMI2Q96E14 147 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 Q9UF83 564 aa10.47□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0J9YXV3 536 aa10.46□□□□□ -0.73
SPCS1-201ENST00000233025 S100A8P05109 93 aa10.46□□□□□ -0.73
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SPCS1-201ENST00000233025 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0U1RQV1 116 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 A8MWV9 139 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 HIST1H2BKO60814 126 aa10.45□□□□□ -0.74
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SPCS1-201ENST00000233025 HIST1H2BOP23527 126 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 HIST1H2BBP33778 126 aa10.45□□□□□ -0.74
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SPCS1-201ENST00000233025 HIST2H2BEQ16778 126 aa10.45□□□□□ -0.74
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SPCS1-201ENST00000233025 HIST1H2BHQ93079 126 aa10.45□□□□□ -0.74
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SPCS1-201ENST00000233025 HIST1H2BNQ99877 126 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 HIST1H2BMQ99879 126 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 SAMD10Q9BYL1 202 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 JPT2Q9H910 190 aa10.45□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GW15 77 aa10.44□□□□□ -0.74
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SPCS1-201ENST00000233025 CRIP1P50238 77 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 HBBP68871 147 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 GAGE1Q13065 139 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 GAGE4Q13068 117 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 GAGE5Q13069 117 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 RIGQ13278 110 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 GAGE13Q4V321 117 aa10.44□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 C5orf52A6NGY3 159 aa10.43□□□□□ -0.74
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SPCS1-201ENST00000233025 TMEM136Q6ZRR5 245 aa10.43□□□□□ -0.74
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SPCS1-201ENST00000233025 APCSP02743 223 aa10.42□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 C14orf177Q52M58 125 aa10.42□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 GTSF1Q8WW33 167 aa10.42□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 PHOX2AO14813 284 aa10.41□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 GZMBP10144 247 aa10.41□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 CAMPP49913 170 aa10.41□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 TPPP3Q9BW30 176 aa10.41□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 S100A2P29034 98 aa10.4□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 AKR1D1P51857 326 aa10.4□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa10.4□□□□□ -0.74
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GXF2 115 aa10.39□□□□□ -0.75
SPCS1-201ENST00000233025 RHODO00212 210 aa10.39□□□□□ -0.75
SPCS1-201ENST00000233025 ARMS2P0C7Q2 107 aa10.39□□□□□ -0.75
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf163Q8N9P6 203 aa10.39□□□□□ -0.75
SPCS1-201ENST00000233025 GRIFINA4D1Z8 144 aa10.38□□□□□ -0.75
SPCS1-201ENST00000233025 F2Z2F3 143 aa10.38□□□□□ -0.75
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