RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 SEM1Q6ZVN7 128 aa4.88□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.88□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 CACNA1EQ15878 2313 aa4.88□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 GNRH2O43555 120 aa4.88□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 YPEL4Q96NS1 127 aa4.88□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 UBE2D3P61077 147 aa4.88□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 U3KQK5 164 aa4.88□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 PKDREJQ9NTG1 2253 aa4.88□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 IGLC6P0CF74 106 aa4.88□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 M0R378 163 aa4.87□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 MIFP14174 115 aa4.87□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 MLANAQ16655 118 aa4.87□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 ODF3L1Q8IXM7 274 aa4.87□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 C5orf56Q8N8D9 126 aa4.87□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 PLXNA2O75051 1894 aa4.87□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 A0A087WV48 116 aa4.87□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.87□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 RNF144BQ7Z419 303 aa4.87□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa4.87□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.87□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 FER1L5A0AVI2 2057 aa4.87□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 LST1O00453 97 aa4.86□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.86□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.86□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM223A0PJW6 202 aa4.86□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 Q6ZQT7 251 aa4.86□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 F8W735 103 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 RETNQ9HD89 108 aa4.86□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.86□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 DEFB113Q30KQ7 82 aa4.86□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 DENND4AQ7Z401 1863 aa4.86□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 TFF1P04155 84 aa4.86□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 HILS1P60008 231 aa4.86□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 A0A0U1RQV1 116 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 REG3AQ06141 175 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 CLEC2BQ92478 149 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 ZNRD1Q9P1U0 126 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 IGF1P05019 195 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 MLST8Q9BVC4 326 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 Q9HAA7 133 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 MYLKQ15746 1914 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 CCKP06307 115 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 NCR3O14931 201 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 IGLV1-47P01700 117 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 UBE2D1P51668 147 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 CXCL6P80162 114 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 WISP1O95388 367 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 PRORYQ9H606 182 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 BRWD3Q6RI45 1802 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 A0A087WW49 117 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 SPRY2O43597 315 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 LIMD2Q9BT23 127 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 LY6DQ14210 128 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 MED12Q93074 2177 aa4.84□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.84□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 NLRC5Q86WI3 1866 aa4.84□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 hDV103S1A0JD37 113 aa4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 IGHV3-33P01772 117 aa4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 DEFB112Q30KQ8 113 aa4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 FAM215AQ9Y5M1 114 aa4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 A0A0J9YY99 117 aa4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 WT1P19544 449 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 ENHOQ6UWT2 76 aa4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 Q8N9W7 124 aa4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 PLA2G2CQ5R387 149 aa4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 C11orf53Q8IXP5 236 aa4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 IGLV2-23P01705 113 aa4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 PATE2Q6UY27 113 aa4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 RLFQ13129 1914 aa4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 SYCNQ0VAF6 134 aa4.83□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.82□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 ASPHD1Q5U4P2 390 aa4.82□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.82□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 KLK12Q9UKR0 248 aa4.82□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 FRMPD3Q5JV73 1810 aa4.82□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.82□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 H3BPC8 53 aa4.82□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 Q8IZM0 81 aa4.82□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.82□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 WFDC10AQ9H1F0 79 aa4.82□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 SHANK1Q9Y566 2161 aa4.82□□□□□ -1.64
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
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