RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	NUP35	Q8NFH5	326 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	KIR2DL4	Q99706	377 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	CNFN	Q9BYD5	112 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A1B0GUT8	65 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	C7orf71	A4D174	169 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139		F6UB75	175 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	INS	P01308	110 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	OR5AL1	P0C617	328 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	CACNG7	P62955	275 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	TDRG1	Q3Y452	100 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	AMTN	Q6UX39	209 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	RETN	Q9HD89	108 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A087WYN8	130 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A1B0GXF2	115 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	SNAI2	O43623	268 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	IGKV3-20	P01619	116 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	IGLC6	P0CF74	106 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	ASIP	P42127	132 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	TCL1A	P56279	114 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	VAMP3	Q15836	100 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	C6orf223	Q8N319	242 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	GATD1	Q8NB37	220 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	GTSF1	Q8WW33	167 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	DNHD1	Q96M86	4753 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	S100A6	P06703	90 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	PRR9	Q5T870	116 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	KNCN	A6PVL3	124 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	APCS	P02743	223 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	TRGC2	P03986	189 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	TRGC1	P0CF51	173 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	RAB4B	P61018	213 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	FRZB	Q92765	325 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	NAGK	Q9UJ70	344 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139		M0R2Z0	102 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	SERF1A	O75920	110 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	GZMB	P10144	247 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	DEFB1	P60022	68 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	ZFP82	Q8N141	532 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	PTH2	Q96A98	100 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139		H3BVH4	76 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	PHOX2A	O14813	284 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	SPINK4	O60575	86 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	PPBP	P02775	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	CD7	P09564	240 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	APOC4	P55056	127 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CNOT1-222	ENST00000570139	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		4.99	□□□□□ -1.61

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