RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	OR5AL1	P0C617	328 aa		6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	SULT1A2	P50226	295 aa		6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE2D3	P61077	147 aa		6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE2D2	P62837	147 aa		6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF56	Q15929	161 aa		6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	NIT1	Q86X76	327 aa		6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	C11orf52	Q96A22	123 aa		6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	COX11	Q9Y6N1	276 aa		6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A087WX48	190 aa		6.25	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	EPM2A	B3EWF7	344 aa		6.25	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479		F5H697	171 aa		6.25	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	PDE6D	O43924	150 aa		6.25	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	IFNA1	P01562	189 aa		6.25	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM17	P0DL12	118 aa		6.25	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	S100P	P25815	95 aa		6.25	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	ELOB	Q15370	118 aa		6.25	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		6.25	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	DERL1	Q9BUN8	251 aa		6.25	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM262	E9PQX1	116 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	GNG4	P50150	75 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	BLOC1S1	P78537	153 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	CENPW	Q5EE01	88 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	RMI2	Q96E14	147 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM12	Q96EX1	92 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	KLK12	Q9UKR0	248 aa		6.24	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	XKRY2	A2RUG3	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	IGLV2-8	P01709	118 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	PEA15	Q15121	130 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	BAALC	Q8WXS3	180 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	FRZB	Q92765	325 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	TPPP3	Q9BW30	176 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	VAX2	Q9UIW0	290 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		6.23	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	LECT2	O14960	151 aa		6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479		P01737	135 aa		6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	IGLC6	P0CF74	106 aa		6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	GZMB	P10144	247 aa		6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	BCL2	P10415	239 aa		6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	CACNG7	P62955	275 aa		6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479		Q0VG73	95 aa		6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE2W	Q96B02	151 aa		6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	AP1S3	Q96PC3	154 aa		6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		6.22	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479		F2Z2F3	143 aa		6.21	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	MT-ND4L	P03901	98 aa		6.21	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	WFDC2	Q14508	124 aa		6.21	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479		Q8N976	141 aa		6.21	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		6.21	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		6.21	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		6.21	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM229A	H3BQW9	127 aa		6.2	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479		H7C1H1	209 aa		6.2	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	MGP	P08493	103 aa		6.2	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		6.2	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	PKIA	P61925	76 aa		6.2	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479		Q5VSD8	79 aa		6.2	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	ATRAID	Q6UW56	229 aa		6.2	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		6.2	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		6.2	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		6.2	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	NUDT11	Q96G61	164 aa		6.2	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		6.2	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		6.19	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479		M0QY20	66 aa		6.19	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	CRP	P02741	224 aa		6.19	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	TRGC1	P0CF51	173 aa		6.19	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	NTF3	P20783	257 aa		6.19	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	HAMP	P81172	84 aa		6.19	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	MPV17L2	Q567V2	206 aa		6.19	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR73	Q6P4I2	378 aa		6.19	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	ENHO	Q6UWT2	76 aa		6.19	□□□□□ -1.42
KIFC3-231	ENST00000567479	OCC1	Q8TAD7	63 aa		6.19	□□□□□ -1.42

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