RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 TPT1P13693 172 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 GNG5P63218 68 aa5.84□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 THAP6Q8TBB0 222 aa5.84□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 SFRP2Q96HF1 295 aa5.84□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 MLST8Q9BVC4 326 aa5.84□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.84□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 MED28Q9H204 178 aa5.84□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 ALG5Q9Y673 324 aa5.84□□□□□ -1.47
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.83□□□□□ -1.48
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SMAD3-211ENST00000559460 B4DEV8 164 aa5.83□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 CYCSP99999 105 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF674Q2M3X9 581 aa5.83□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 ZFP82Q8N141 532 aa5.83□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.83□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 PSG8Q9UQ74 426 aa5.83□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 SSNA1O43805 119 aa5.82□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 PFDN1O60925 122 aa5.82□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 IGLV7-43P04211 117 aa5.82□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 ARMS2P0C7Q2 107 aa5.82□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 RAB4BP61018 213 aa5.82□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa5.82□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 PRNTQ86SH4 94 aa5.82□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 CARD19Q96LW7 228 aa5.82□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1B0GVG6 124 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 UBE2L6O14933 153 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 CRYGAP11844 174 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 AMTP48728 403 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 GAGE2BQ13066 116 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 RAB32Q13637 225 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 AKAP14Q86UN6 197 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 AQP10Q96PS8 301 aa5.81□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 IGSF23A1L1A6 192 aa5.8□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 F5H697 171 aa5.8□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 GIPP09681 153 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 IQCJQ1A5X6 159 aa5.8□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.8□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.8□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1B0GUV1 79 aa5.79□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 GRIFINA4D1Z8 144 aa5.79□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 M0R036 132 aa5.79□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 TCRAP04437 139 aa5.79□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 PTTG1IPP53801 180 aa5.79□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.79□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.79□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 TSKUQ8WUA8 353 aa5.79□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM243Q9BU79 118 aa5.79□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.78□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.78□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 A0A087WZ39 114 aa5.78□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.78□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1W2PPV4 95 aa5.78□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 NHLH2Q02577 135 aa5.78□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 IL15RAQ13261 267 aa5.78□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.78□□□□□ -1.48
SMAD3-211ENST00000559460 H0YIZ8 118 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 PET100P0DJ07 73 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 H2BFSP57053 126 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 TPRXLQ17RH7 258 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 ISOC2Q96AB3 205 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1W2PNN7 141 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 HMSDA8MTL9 139 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 SMIM17P0DL12 118 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 FGF6P10767 208 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 SYCNQ0VAF6 134 aa5.76□□□□□ -1.49
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SMAD3-211ENST00000559460 DNLZQ5SXM8 178 aa5.76□□□□□ -1.49
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SMAD3-211ENST00000559460 PRR27Q6MZM9 219 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 KRBOX1C9JBD0 128 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 MPC2O95563 127 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
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