RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552915.5

CNOT2-241, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene CNOT2, Length 1,071 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2-241ENST00000552915 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.61□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 SRIP30626 198 aa8.61□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.61□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.61□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.61□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 F5H768 121 aa8.6□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 ATP5G1P05496 136 aa8.6□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 ORMDL3Q8N138 153 aa8.6□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.6□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 MRAP2Q96G30 205 aa8.6□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 PRELID3AQ96N28 172 aa8.6□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 GAS8-AS1O95177 125 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 P0DMU3 169 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 FAM231AP0DMU4 169 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 FAM231CP0DMU5 169 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 LINC00315P59091 139 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 C12orf74Q32Q52 190 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 Q6ZTC4 211 aa8.59□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CNOT2-241ENST00000552915 H7C1H1 209 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 K7EQD1 137 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 NPYP01303 97 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 RAB5BP61020 215 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 IQCJQ1A5X6 159 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 Q6ZSN1 163 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.58□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 A0A0J9YY99 117 aa8.57□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.57□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 FHL2Q14192 279 aa8.57□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 U3KQK5 164 aa8.57□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 TNFRSF6BO95407 300 aa8.56□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 PPBPP02775 128 aa8.56□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.56□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.56□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 GAGE12JA6NER3 117 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 M0QY20 66 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 CIDEAO60543 219 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 GAGE1Q13065 139 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 GAGE4Q13068 117 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 GAGE5Q13069 117 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 RHOHQ15669 191 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 GAGE13Q4V321 117 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 C18orf15Q96N68 181 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 ST20Q9HBF5 79 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.55□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 PHOX2AO14813 284 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 NDUFA6P56556 154 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 NRACQ8N912 160 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 NIT2Q9NQR4 276 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 PRO0255Q9UI72 69 aa8.54□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 HIST1H2BKO60814 126 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 PPP1R17O96001 155 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 HIST1H2BJP06899 126 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 HIST1H2BOP23527 126 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 HIST1H2BBP33778 126 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 CRYBA4P53673 196 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 HIST1H2BDP58876 126 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 HIST1H2BCP62807 126 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 BAGE3Q86Y29 109 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.53□□□□□ -1.04
CNOT2-241ENST00000552915 A0A096LPF7 62 aa8.52□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.52□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 GYPEP15421 78 aa8.52□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 FA2HQ7L5A8 372 aa8.52□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.52□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 Q9UF83 564 aa8.52□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.52□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.52□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.51□□□□□ -1.05
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