RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546211.5

SKP2-208, Transcript of S-phase kinase associated protein 2, human

TSL 5 BASIC

Gene SKP2, Length 1,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKP2-208	ENST00000546211	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	LEPROTL1	O95214	131 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211		Q6ZSN1	163 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	LYRM9	A8MSI8	78 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211		K7EMI3	77 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	VCY	O14598	125 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	TCAP	O15273	167 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	HBD	P02042	147 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	LAGE3	Q14657	143 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211		Q8NAQ8	132 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	DEFB130B	P0DP73	79 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	DEFB130A	P0DP74	79 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	SMIM6	P0DI80	62 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	DEFB4A	O15263	64 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211		P0DMU3	169 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	FAM231A	P0DMU4	169 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	FAM231C	P0DMU5	169 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	FCER1G	P30273	86 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	C18orf15	Q96N68	181 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	KIR2DL4	Q99706	377 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211		A0A096LNJ9	63 aa		13.83	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	KRTDAP	P60985	99 aa		13.83	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	PYY3	Q5JQD4	70 aa		13.83	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		13.83	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	NACA	E9PAV3	2078 aa		13.83	□□□□□ -0.19
SKP2-208	ENST00000546211	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211		K7EQD1	137 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	DKK2	Q9UBU2	259 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	NUDT3	O95989	172 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211		I3L3M4	83 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211		K7EIL1	84 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	C3orf79	P0CE67	100 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	RETN	Q9HD89	108 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	SCGB1D1	O95968	90 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	C12orf57	Q99622	126 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	G0S2	P27469	103 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	DAD1	P61803	113 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	FHL2	Q14192	279 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211		Q9UF83	564 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKP2-208	ENST00000546211	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	RHOH	Q15669	191 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	CELA1	Q9UNI1	258 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	TSHB	P01222	138 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	TOMM6	Q96B49	74 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	LINC01549	A6NIU2	74 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	SPATA25	Q9BR10	227 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	GAGE12J	A6NER3	117 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	ATP5L	O75964	103 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	GAGE1	Q13065	139 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	GAGE4	Q13068	117 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	GAGE5	Q13069	117 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	GAGE13	Q4V321	117 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	ATP5G1	P05496	136 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	PET117	Q6UWS5	81 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	C20orf202	A1L168	122 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211		H0Y8G0	127 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	COTL1	Q14019	142 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	MRAP	Q8TCY5	172 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	PRO0255	Q9UI72	69 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SKP2-208	ENST00000546211	UBE2D3	P61077	147 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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