RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.81□□□□□ -0.04
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PACSIN3-211ENST00000539589 M0QY20 66 aa14.8□□□□□ -0.04
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PACSIN3-211ENST00000539589 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
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PACSIN3-211ENST00000539589 STHQ8IWL8 128 aa14.78□□□□□ -0.04
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PACSIN3-211ENST00000539589 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa14.76□□□□□ -0.05
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PACSIN3-211ENST00000539589 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa14.76□□□□□ -0.05
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PACSIN3-211ENST00000539589 PCP2Q8IVA1 136 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 PTH2Q96A98 100 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 A8MWV9 139 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 BAALCQ8WXS3 180 aa14.75□□□□□ -0.05
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PACSIN3-211ENST00000539589 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa14.74□□□□□ -0.05
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PACSIN3-211ENST00000539589 I3L3M4 83 aa14.7□□□□□ -0.06
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PACSIN3-211ENST00000539589 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa14.69□□□□□ -0.06
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PACSIN3-211ENST00000539589 HSD52Q0P140 79 aa14.68□□□□□ -0.06
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PACSIN3-211ENST00000539589 C1orf158Q8N1D5 194 aa14.67□□□□□ -0.06
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PACSIN3-211ENST00000539589 C9orf66Q5T8R8 295 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 HIGD1BQ9P298 99 aa14.66□□□□□ -0.06
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PACSIN3-211ENST00000539589 COL6A5A8TX70 2615 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 AZU1P20160 251 aa14.64□□□□□ -0.07
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PACSIN3-211ENST00000539589 CST9LQ9H4G1 147 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 P0DMU3 169 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM231AP0DMU4 169 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM231CP0DMU5 169 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TAX1BP3O14907 124 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 RS1O15537 224 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa14.62□□□□□ -0.07
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