RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LELP1Q5T871 98 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LINC00473A8K010 186 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NPYP01303 97 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CTSGP08311 255 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q0VFX4 171 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FXYD5Q96DB9 178 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C2orf70A6NJV1 201 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGLC7A0M8Q6 106 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UBE2D1P51668 147 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OCC1Q8TAD7 63 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C18orf32Q8TCD1 76 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIST1H2BKO60814 126 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIST1H2BJP06899 126 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIST1H2BOP23527 126 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIST1H2BBP33778 126 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIST1H2BDP58876 126 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIST1H2BCP62807 126 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGLL5B9A064 214 aa3.47□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A1B0GXF2 115 aa3.46□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q8N9W7 124 aa3.46□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.46□□□□□ -1.85
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRSS29PA6NIE9 313 aa3.46□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C20orf197Q8N268 126 aa3.46□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 COX7B2Q8TF08 81 aa3.46□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FANCD2OSQ96PS1 177 aa3.46□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ATRQ13535 2644 aa3.46□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.46□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa3.46□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa3.46□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 U3KQA8 63 aa3.46□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.46□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PSMB8P28062 276 aa3.46□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.46□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 I3L2K1 104 aa3.46□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.46□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 REG3GQ6UW15 175 aa3.46□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADCYAP1P18509 176 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A087WZ39 114 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGHV3-53P01767 116 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NPC2P61916 151 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM30AQ9NZY2 134 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 J3KRW8 73 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DMRTC1Q5HYR2 192 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C9orf118A6NHY6 69 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KNCNA6PVL3 124 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 M0QXV9 152 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RS1O15537 224 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HTN3P15516 51 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q6Q795 121 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C3orf84H3BNL1 204 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRANK1O15050 2925 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 E9PLD3 99 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CRYBA2P53672 197 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NREPQ16612 68 aa3.45□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGKV1-39P01597 117 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGKV1D-39P04432 117 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GYPEP15421 78 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNRF2Q8NHG8 242 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UBE2D3P61077 147 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF664Q8N3J9 261 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGKV1D-12P01611 117 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 INSL4Q14641 139 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HECTD1Q9ULT8 2610 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CFAP46Q8IYW2 2715 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGHV3-11P01762 117 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CRYGBP07316 175 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DEFB130BP0DP73 79 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DEFB130AP0DP74 79 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SVIPQ8NHG7 77 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A1B0GV90 55 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGKV1-5P01602 117 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UBE2V1Q13404 147 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAP6D1Q9H9H5 199 aa3.44□□□□□ -1.86
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GAGE12BA1L429 117 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 140.8 ms