RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497183.5

PRKCZ-223, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 3

Gene PRKCZ, Length 763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-223	ENST00000497183	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		5	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		5	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	ZFP82	Q8N141	532 aa		5	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		5	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	LINC01587	Q99440	93 aa		5	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		5	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183		H3BNG1	76 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	APCS	P02743	223 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	NTF3	P20783	257 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	CTRL	P40313	264 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	TNXB	P22105	4242 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183		A0A087WTM6	91 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183		A0A096LPF7	62 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183		A0A0J9YY99	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183		A0A1B0GXF2	115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	SNAI2	O43623	268 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	S100A6	P06703	90 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	MUC2	Q02817	5179 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183		M0R381	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	NDUFA6	P56556	154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCZ-223	ENST00000497183	LRP2	P98164	4655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183		Q6ZSN1	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	SPX	Q9BT56	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	SRI	P30626	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	SLA	Q13239	276 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183		Q6ZTI0	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183		M0R2P5	195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	PHOX2A	O14813	284 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	SIVA1	O15304	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	GAGE7	O76087	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	NXPH4	O95158	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	MGP	P08493	103 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	EVI2A	P22794	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	CKS2	P33552	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183		D6R8Y8	96 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183		F5H697	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	PPBP	P02775	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	RAB4A	P20338	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	GCSH	P23434	173 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKCZ-223	ENST00000497183		Q6ZSA8	131 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.8 ms