RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494570.1

KDM4C-211, Transcript of lysine demethylase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene KDM4C, Length 647 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4C-211ENST00000494570 GAGE12JA6NER3 117 aa5.54□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 RHODO00212 210 aa5.54□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 GAGE1Q13065 139 aa5.54□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 GAGE4Q13068 117 aa5.54□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 GAGE5Q13069 117 aa5.54□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 GAGE13Q4V321 117 aa5.54□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.54□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.54□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.54□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 NUDT11Q96G61 164 aa5.54□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.54□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.54□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 C9JQL5 133 aa5.53□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 TMEM250H0YL14 139 aa5.53□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.53□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 LELP1Q5T871 98 aa5.53□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.53□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.53□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 FAM210AQ96ND0 272 aa5.53□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 LY96Q9Y6Y9 160 aa5.53□□□□□ -1.52
KDM4C-211ENST00000494570 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.52□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 P01737 135 aa5.52□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 RAB4BP61018 213 aa5.52□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 UBE2D3P61077 147 aa5.52□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 SSTP61278 116 aa5.52□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 UBE2D2P62837 147 aa5.52□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 TEX261Q6UWH6 196 aa5.52□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.52□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.52□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 GTSF1Q8WW33 167 aa5.52□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 CNFNQ9BYD5 112 aa5.52□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.51□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 K7EP13 123 aa5.51□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 CTRLP40313 264 aa5.51□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 PTTG1IPP53801 180 aa5.51□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.51□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.51□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.51□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.51□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.5□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 M0QY20 66 aa5.5□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 EVI2AP22794 236 aa5.5□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.5□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 WDR73Q6P4I2 378 aa5.5□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.5□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 TPPP3Q9BW30 176 aa5.5□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 BIN3Q9NQY0 253 aa5.5□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 F2Z2F3 143 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 IGHV3-30P01768 117 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 IGHV3-33P01772 117 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 NTF3P20783 257 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 CACNG7P62955 275 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 LINC01551Q86U37 167 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 DNAJC30Q96LL9 226 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.49□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 A0A087WTM6 91 aa5.48□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 XKRY2A2RUG3 117 aa5.48□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.48□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 CEBPGP53567 150 aa5.48□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF56Q15929 161 aa5.48□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.48□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 NIT1Q86X76 327 aa5.48□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.48□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 AP1S3Q96PC3 154 aa5.48□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.48□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 A0A087WWC5 75 aa5.47□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF727A8MUV8 499 aa5.47□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 PCP4P48539 62 aa5.47□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 NFE4Q86UQ8 179 aa5.47□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.47□□□□□ -1.53
KDM4C-211ENST00000494570 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.46□□□□□ -1.54
KDM4C-211ENST00000494570 C16orf90A8MZG2 172 aa5.46□□□□□ -1.54
KDM4C-211ENST00000494570 F5H697 171 aa5.46□□□□□ -1.54
KDM4C-211ENST00000494570 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
KDM4C-211ENST00000494570 LAGE3Q14657 143 aa5.46□□□□□ -1.54
KDM4C-211ENST00000494570 TWIST1Q15672 202 aa5.46□□□□□ -1.54
KDM4C-211ENST00000494570 GATD1Q8NB37 220 aa5.46□□□□□ -1.54
KDM4C-211ENST00000494570 ISOC2Q96AB3 205 aa5.46□□□□□ -1.54
KDM4C-211ENST00000494570 OSTCQ9NRP0 149 aa5.46□□□□□ -1.54
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