RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484846.1

EHD1-209, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene EHD1, Length 3,469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-209ENST00000484846 HIGD1BQ9P298 99 aa9.92□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.92□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 A4D1N5 150 aa9.91□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 OVOL1O14753 267 aa9.91□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 IGHV4-59P01825 116 aa9.91□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 GPHB5Q86YW7 130 aa9.91□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 ITPR3Q14573 2671 aa9.91□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 FBN2P35556 2912 aa9.91□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 AVPP01185 164 aa9.91□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 RAX2Q96IS3 184 aa9.91□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 APCP25054 2843 aa9.91□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 C11orf86A6NJI1 115 aa9.91□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 Q6ZUT4 128 aa9.91□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 TM2D2Q9BX73 214 aa9.91□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.9□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.9□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 B4DSR2 109 aa9.9□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 MSMBP08118 114 aa9.9□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 ZFP2Q6ZN57 461 aa9.9□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 PRM2P04554 102 aa9.9□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 Q1RN00 199 aa9.9□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 RRN3P1Q2M238 152 aa9.9□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 CDIP1Q9H305 208 aa9.9□□□□□ -0.82
EHD1-209ENST00000484846 FAM223BA6NKX1 122 aa9.9□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.9□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 MDFICQ9P1T7 246 aa9.9□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 KNCNA6PVL3 124 aa9.89□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 E9PLD3 99 aa9.89□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 FHL3Q13643 280 aa9.89□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 TEX29Q8N6K0 151 aa9.89□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 TOMM6Q96B49 74 aa9.89□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 DUX3Q96PT4 197 aa9.89□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.89□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 NDUFA4O00483 81 aa9.89□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.89□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 HERVK_113P61574 105 aa9.88□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 NPC2P61916 151 aa9.88□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.88□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 PRSS2P07478 247 aa9.88□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 WFDC11Q8NEX6 87 aa9.88□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 PIFOQ8TCI5 191 aa9.88□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 SYNJ2BPP57105 145 aa9.88□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.88□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.87□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 GAGE12JA6NER3 117 aa9.87□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 GAGE7O76087 117 aa9.87□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 GAGE12FP0CL80 117 aa9.87□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 GAGE12GP0CL81 117 aa9.87□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 GAGE12IP0CL82 117 aa9.87□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 GAGE4Q13068 117 aa9.87□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 DEFB112Q30KQ8 113 aa9.87□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 U3KQE9 123 aa9.87□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 F8W1H4 67 aa9.87□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 DEFB136Q30KP8 78 aa9.87□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.86□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.86□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.85□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 ZNF876PQ49A33 203 aa9.85□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 FOXI1Q12951 378 aa9.84□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 SPXQ9BT56 116 aa9.84□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 P0DMU3 169 aa9.84□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 FAM231AP0DMU4 169 aa9.84□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 FAM231CP0DMU5 169 aa9.84□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 Q8N1Y9 231 aa9.84□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 VCYO14598 125 aa9.84□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 PMVKQ15126 192 aa9.84□□□□□ -0.83
EHD1-209ENST00000484846 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.83□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.83□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 USMG5Q96IX5 58 aa9.83□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.83□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.83□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 TTC32Q5I0X7 151 aa9.83□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 NFE4Q86UQ8 179 aa9.83□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.83□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 ZNF580Q9UK33 172 aa9.83□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.83□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 A0A0U1RRA0 63 aa9.82□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 A0A1W2PRX2 142 aa9.82□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 LINC01546A6NGU7 62 aa9.82□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.82□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 TSHBP01222 138 aa9.82□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 CRYGDP07320 174 aa9.82□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 TAL2Q16559 108 aa9.82□□□□□ -0.84
EHD1-209ENST00000484846 VCX2Q9H322 139 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.3 ms