RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 AP1S3Q96PC3 154 aa4.43□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 DPH3P1Q9H4G8 78 aa4.43□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 A0A096LNJ9 63 aa4.42□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.42□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 CRYGDP07320 174 aa4.42□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.42□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.42□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.42□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.42□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM208Q9BTX3 173 aa4.42□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 PRO1933Q9H354 126 aa4.42□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 MAP1LC3AQ9H492 121 aa4.42□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 STAB1Q9NY15 2570 aa4.42□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa4.41□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.41□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 TCAPO15273 167 aa4.41□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 PPBPP02775 128 aa4.41□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 SMIM17P0DL12 118 aa4.41□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 P0DMU3 169 aa4.41□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 FAM231AP0DMU4 169 aa4.41□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 FAM231CP0DMU5 169 aa4.41□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF415Q09FC8 603 aa4.41□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.41□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 C3orf56Q8N813 242 aa4.41□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 Q8N8P6 123 aa4.41□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 MRAP2Q96G30 205 aa4.41□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.41□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.41□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 Q9UF83 564 aa4.41□□□□□ -1.7
SKAP2-204ENST00000481204 A0A0A0MQY5 61 aa4.4□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 H0Y8G0 127 aa4.4□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 M0R2P5 195 aa4.4□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 LEPROTL1O95214 131 aa4.4□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF56Q15929 161 aa4.4□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 MAJINQ3KP22 176 aa4.4□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 GTSCR1Q86UQ5 136 aa4.4□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 ATOH7Q8N100 152 aa4.4□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.4□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.4□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM158Q8WZ71 300 aa4.4□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.4□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.4□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 C20orf144Q9BQM9 153 aa4.4□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 MAST4O15021 2626 aa4.4□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 LINC01546A6NGU7 62 aa4.39□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 M0QY20 66 aa4.39□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 HBDP02042 147 aa4.39□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 INSL3P51460 131 aa4.39□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.39□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.39□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 C12orf54Q6X4T0 127 aa4.39□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 Q6ZTI0 123 aa4.39□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.39□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 C18orf15Q96N68 181 aa4.39□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.39□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 CSTL1Q9H114 145 aa4.39□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.39□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa4.39□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 LINC00587B1AMM8 73 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 RS1O15537 224 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 IGHV3-53P01767 116 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 FCER1GP30273 86 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 EMP1P54849 157 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP10-11P60412 298 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 LAGE3Q14657 143 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 RNF183Q96D59 192 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 SPXQ9BT56 116 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM70Q9BUB7 260 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 ST20Q9HBF5 79 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 DKK2Q9UBU2 259 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4.38□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 DEFB4AO15263 64 aa4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 GAGE7O76087 117 aa4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 SLPIP03973 132 aa4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 GAGE12FP0CL80 117 aa4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 GAGE12GP0CL81 117 aa4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 GAGE12IP0CL82 117 aa4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 VPREB1P12018 145 aa4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 PTH2Q96A98 100 aa4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF479Q96JC4 524 aa4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 C20orf78Q9BR46 151 aa4.37□□□□□ -1.71
SKAP2-204ENST00000481204 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76 ms