RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
PRPF40A-208ENST00000472760 COPZ1P61923 177 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRPF40A-208ENST00000472760 S100A7L2Q5SY68 101 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRPF40A-208ENST00000472760 KCNRGQ8N5I3 272 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRPF40A-208ENST00000472760 WFDC6Q9BQY6 131 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRPF40A-208ENST00000472760 CEP152O94986 1710 aa-0.02□□□□□ -2.41
PRPF40A-208ENST00000472760 IGF2RP11717 2491 aa-0.03□□□□□ -2.41
PRPF40A-208ENST00000472760 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-0.03□□□□□ -2.41
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PRPF40A-208ENST00000472760 NDUFB6O95139 128 aa-0.03□□□□□ -2.41
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PRPF40A-208ENST00000472760 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
PRPF40A-208ENST00000472760 LAMB1P07942 1786 aa-0.04□□□□□ -2.42
PRPF40A-208ENST00000472760 FSIP2Q5CZC0 6907 aa-0.04□□□□□ -2.42
PRPF40A-208ENST00000472760 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-0.04□□□□□ -2.42
PRPF40A-208ENST00000472760 MYH13Q9UKX3 1938 aa-0.04□□□□□ -2.42
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PRPF40A-208ENST00000472760 SMCO1Q147U7 214 aa-0.05□□□□□ -2.42
PRPF40A-208ENST00000472760 CADP27708 2225 aa-0.05□□□□□ -2.42
PRPF40A-208ENST00000472760 SSPOA2VEC9 5147 aa-0.05□□□□□ -2.42
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PRPF40A-208ENST00000472760 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa-0.06□□□□□ -2.42
PRPF40A-208ENST00000472760 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-0.06□□□□□ -2.42
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PRPF40A-208ENST00000472760 AKAP11Q9UKA4 1901 aa-0.07□□□□□ -2.42
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PRPF40A-208ENST00000472760 CELSR2Q9HCU4 2923 aa-0.1□□□□□ -2.42
PRPF40A-208ENST00000472760 PARP14Q460N5 1801 aa-0.1□□□□□ -2.43
PRPF40A-208ENST00000472760 PIN1P1O15428 100 aa-0.1□□□□□ -2.43
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PRPF40A-208ENST00000472760 Q5VV11 94 aa-0.1□□□□□ -2.43
PRPF40A-208ENST00000472760 CCDC167Q9P0B6 97 aa-0.1□□□□□ -2.43
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PRPF40A-208ENST00000472760 A0A0D9SFI3 127 aa-0.11□□□□□ -2.43
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PRPF40A-208ENST00000472760 R4GMQ9 66 aa-0.17□□□□□ -2.44
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PRPF40A-208ENST00000472760 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa-0.19□□□□□ -2.44
PRPF40A-208ENST00000472760 M0R3E3 92 aa-0.2□□□□□ -2.44
PRPF40A-208ENST00000472760 RBM3P98179 157 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
PRPF40A-208ENST00000472760 NWD2Q9ULI1 1742 aa-0.21□□□□□ -2.44
PRPF40A-208ENST00000472760 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-0.21□□□□□ -2.44
PRPF40A-208ENST00000472760 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-0.21□□□□□ -2.44
PRPF40A-208ENST00000472760 C10orf128Q5T292 105 aa-0.21□□□□□ -2.44
PRPF40A-208ENST00000472760 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-0.21□□□□□ -2.44
PRPF40A-208ENST00000472760 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa-0.21□□□□□ -2.44
PRPF40A-208ENST00000472760 C12orf73Q69YU5 71 aa-0.22□□□□□ -2.44
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